【摘要】：目的:對(duì)zrx02嗜酸乳桿菌細(xì)菌素編碼基因進(jìn)行克隆與序列分析。方法:對(duì)分離出的菌株進(jìn)行16S rRNA鑒定,并根據(jù)已報(bào)道的plnD編碼產(chǎn)物基因設(shè)計(jì)引物,以該菌基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序,利用Pro Param tool,TMHMM等在線軟件對(duì)編碼蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果:該菌為嗜酸乳桿菌,命名為嗜酸乳桿菌zrx02,該菌含有plnD基因,通過(guò)與Gen Bank中相關(guān)的抗菌素基因進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)其基因序列與Gen Bank庫(kù)中的Lactobacillus plantarum strain(WP 016526896.1)plnD gene的同源性達(dá)到100%。生物信息學(xué)分析顯示該基因全長(zhǎng)355 bp,編碼92個(gè)氨基酸,相對(duì)分子量10.54 ku,理論等電點(diǎn)9.26,該基因編碼蛋白是穩(wěn)定蛋白,不具有明顯的跨膜結(jié)構(gòu),二級(jí)結(jié)構(gòu)主要有α-螺旋、無(wú)規(guī)則卷曲和延伸鏈組成,三級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果顯示plnD蛋白模型與Streptococcus pneumoniae中的ComE同源性最高。結(jié)論:對(duì)嗜酸乳桿菌zrx02 plnD基因的克隆與分析,為進(jìn)一步探究細(xì)菌素的形成機(jī)制奠定理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective: to clone and sequence the bacteriocin encoding gene of Lactobacillus acidophilus zrx02. Methods: the isolated strain was identified by 16s rRNA, and primers were designed according to the reported plnD coding product gene. The genomic DNA was used as template for PCR amplification and sequencing. Pro Param tool-TMHMM and other online software were used for bioinformatics analysis of the encoded protein. Results: Lactobacillus acidophilus was named as Lactobacillus acidophilus zrx02. It contained plnD gene. By comparing with the antimicrobial gene related to Gen Bank, it was found that the homology of the gene sequence with Lactobacillus plantarum strain (WP 016526896.1) plnD gene in Gen Bank library was 100%. Bioinformatics analysis showed that the gene was 355 BP in length, encoding 92 amino acids, the relative molecular weight was 10.54 ku. the theoretical isoelectric point was 9.26. The protein encoded by the gene was stable and had no obvious transmembrane structure, and the secondary structure was mainly 偽 -helix. The results of three-level structure showed that the plnD protein model had the highest homology with ComE in Streptococcus pneumoniae. Conclusion: the cloning and analysis of zrx02 plnD gene of Lactobacillus acidophilus lay a theoretical foundation for further exploring the formation mechanism of bacteriocin.
【作者單位】： 河南科技學(xué)院食品學(xué)院;云南商務(wù)信息工程學(xué)校;
【基金】：河南省高校重點(diǎn)科研項(xiàng)目(18A550006) 河南省高�？萍紕�(chuàng)新人才支持計(jì)劃(17HASTIT037) 河南科技學(xué)院高層次人才科研項(xiàng)目(2015016)
【分類號(hào)】：Q78;TS201.3

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本文編號(hào)：2197039