【摘要】：為了解陜西省豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遺傳和變異情況,對9份疑似感染PRRSV的病料用RT-PCR方法分別擴增ORF3和ORF5基因,并進行測序和序列分析。測序結(jié)果表明,ORF3基因在254-490和646-737位置之間發(fā)生不連續(xù)堿基突變;與GenBank已發(fā)表的國外毒株ORF3基因組比較,同源性為89.2%~94.8%,與國內(nèi)發(fā)表的ORF3基因比較,同源性為88.8%~99.0%,其中與2009年陜西分離株(HQ843181.1)同源性為94.9%~98.7%,與2010年陜西株(KJ855518.1)同源性為94.9%~98.6%。ORF5基因突變主要在508-600堿基位置之間,與GenBank上已發(fā)表的國外毒株ORF5基因組比較,同源性為90.1%~92.1%,與國內(nèi)發(fā)表的ORF5基因比較,同源性為89.6%~99.2%,其中與2009年陜西分離株(HQ843181.1)同源性為95.2%~98.4%,與2010年陜西株(KJ855518.1)同源性為95.2%~98.7%。ORF3和ORF5基因進化樹中Wn-2、Ak-3和Tc-4毒株在同一個進化支上,之間親緣關(guān)系近,Xy-1和Hz-5毒株分別在不同的進化分支上,與其他毒株遺傳距離較遠。陜西省PRRSV流行毒株的ORF5和ORF3基因組與國內(nèi)PRRSV分離株相比較均有一定變異,且親緣進化不完全相同。
[Abstract]:In order to understand the heredity and variation of the Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) virus (PRRSV) virus in Shaanxi Province, the ORF3 and ORF5 genes were amplified by RT-PCR method for 9 suspected PRRSV infected materials, and the sequence and sequence analysis were carried out. The sequencing results showed that the ORF3 genes were 254-490 and 6. The discontinuous base mutation occurred between the 46-737 positions; compared with the published ORF3 genome of GenBank, the homology was 89.2%~94.8%, and the homology was 88.8%~99.0% compared with the ORF3 gene published in China. The homology of the Shaanxi isolate (HQ843181.1) in 2009 was 94.9%~98.7%, and the homology of the Shaanxi strain (KJ855518.1) in 2010 was 94.9%~ The 98.6%.ORF5 gene mutation is mainly between the 508-600 base sites, and the homology is 90.1%~92.1% compared with the published foreign virus ORF5 genome on GenBank. Compared with the ORF5 gene published in China, the homology is 89.6%~99.2%. The homology of the Shaanxi isolate (HQ843181.1) in 2009 is 95.2%~98.4%, and the same as that of the 2010 Shaanxi strain (KJ855518.1). Wn-2, Ak-3 and Tc-4 strains in the phylogenetic tree of 95.2%~98.7%.ORF3 and ORF5 are closely related to the same evolutionary branch. Xy-1 and Hz-5 strains are on different evolutionary branches and are far away from other strains. The ORF5 and ORF3 base of PRRSV epidemic strains in Shaanxi province are compared with those of PRRSV isolates in China. Variation and phylogenetic evolution are not exactly the same.
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;
【基金】：陜西省農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新與攻關(guān)項目(2016NY-095) 西北農(nóng)林科技大學(xué)基本科研業(yè)務(wù)費項目(Z109021427)
【分類號】：S852.651

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