【摘要】：目的:探討與永久性心房顫動(dòng)(p AF)發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的基因和信號(hào)通路,為研究p AF發(fā)生的分子機(jī)制提供基礎(chǔ)。方法:用Agilent 4x44K基因芯片分析p AF患者(n=7例)與竇性心律健康者(n=4例)的左心房組織m RNA,尋找差異表達(dá)的基因。以Gene Ontology(GO)和KEGG、Biocarta數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ),分析差異表達(dá)基因參與的功能和信號(hào)通路。選取差異顯著的部分基因應(yīng)用實(shí)時(shí)定量-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(q RT-PCR)在5例p AF患者與5例竇性心律健康者標(biāo)本進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:表達(dá)譜結(jié)果顯示,共有987個(gè)差異表達(dá)基因,其中567個(gè)基因表達(dá)下調(diào),420個(gè)基因表達(dá)上調(diào)。選取9個(gè)差異顯著的基因在新一組的病例標(biāo)本上應(yīng)用q RT-PCR驗(yàn)證,結(jié)果顯示均有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,且改變與芯片結(jié)果一致。這些基因通過(guò)參與左心房組織纖維化、電重構(gòu)、炎癥、細(xì)胞應(yīng)激、代謝調(diào)節(jié)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)等與p AF的發(fā)生密切相關(guān)。GO和Pathway分析表明下調(diào)的基因主要參與調(diào)節(jié)代謝,表達(dá)上調(diào)的基因影響細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)、免疫應(yīng)答、血小板活化等過(guò)程。結(jié)論:通過(guò)基因芯片技術(shù)發(fā)現(xiàn)與p AF發(fā)生相關(guān)的重要基因,通過(guò)影響細(xì)胞代謝、炎癥、免疫應(yīng)答、血栓形成等參與左心房的結(jié)構(gòu)、功能重構(gòu)。
[Abstract]:Aim: to explore the gene and signal pathways related to the occurrence and development of permanent atrial fibrillation (PAF), and to provide a basis for studying the molecular mechanism of PAF. Methods: Agilent 4x44K gene microarray was used to analyze the mRNAs in left atrium of 7 patients with Agilent and 4 healthy subjects with sinus rhythm, and the differentially expressed genes were found. On the basis of Gene Ontology (go) and KEGGfBiocarta database, the function and signaling pathway of differentially expressed genes were analyzed. Some genes with significant difference were selected for real-time quantification-polymerase chain reaction (Q RT-PCR) to be tested in 5 patients with pAF and 5 healthy controls. Results: the expression profile showed that there were 987 differentially expressed genes, 567 of which were down-regulated and 420 were up-regulated. Nine genes with significant difference were selected to be confirmed by Q RT-PCR in a new group of patients. The results showed that there were statistical differences and the changes were consistent with the results of microarray. These genes involved in left atrial fibrosis, electrical remodeling, inflammation, cellular stress, metabolic regulation, transcriptional regulation and so on were closely related to the occurrence of pAF. Go and Pathway analysis showed that down-regulated genes were mainly involved in regulating metabolism. The up-regulated genes affect cell stress response, immune response, platelet activation and so on. Conclusion: the important genes associated with the development of pAF were found by gene chip technique, and involved in the structural and functional remodeling of left atrium by influencing cell metabolism, inflammation, immune response and thrombosis.
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京朝陽(yáng)醫(yī)院心外科;
【基金】：北京市教委科技面上項(xiàng)目(SQKM201410025018)
【分類(lèi)號(hào)】：R541.75

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本文編號(hào)：2125341