紅皮西洋梨果皮紅色消退候選基因的篩選分析
本文選題:紅巴梨 + 褪色 ; 參考:《西北農(nóng)林科技大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:顏色是果皮重要的外觀品質(zhì),紅皮西洋梨由于其優(yōu)良品質(zhì)深受消費(fèi)者喜愛,但成熟果實(shí)果皮紅色消退問題嚴(yán)重影響了其商品價(jià)值。花青苷是紅色果皮形成的物質(zhì)基礎(chǔ),要確定紅皮西洋梨果皮褪色的分子機(jī)理,必須弄清花青苷合成與消退的關(guān)鍵基因。為此本研究以果實(shí)發(fā)育后期不褪色的‘紅星’(Pyrus communis L.)和果實(shí)發(fā)育后期嚴(yán)重褪色的‘紅巴梨’(Pyrus communis L.)為試驗(yàn)材料,測定果實(shí)不同發(fā)育時(shí)期花青苷含量,分析果皮中花青苷的合成速率和降解速率的變化;根據(jù)花青苷含量變化模式,選擇花后35、75天的果皮材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,結(jié)合熒光定量表達(dá)分析的結(jié)果,確定‘紅巴梨’果皮紅色消退的候選基因。研究結(jié)果如下:1.花后55天,兩者花青苷含量達(dá)到最高;果實(shí)發(fā)育后期,‘紅巴梨’花青苷含量顯著下降,‘紅星’下降但不顯著;整個(gè)發(fā)育時(shí)期,‘紅巴梨’花青苷含量始終低于‘紅星’,與果皮表面顏色變化相一致。2.花青苷高峰期之前(花后35-55天),‘紅巴梨’花青苷合成速率降解速率,花青苷累積含量增加,且保持較高水平;花青苷高峰期之后(花后55-75天),花青苷合成速率顯著降低,降解速率明顯上升,最終合成速率降解速率,花青苷由積累模式轉(zhuǎn)變消耗模式,果皮花青苷含量明顯減少。因此‘紅巴梨’果皮紅色消退是花青苷合成速率降低和花青苷降解速率增加共同導(dǎo)致,但兩者相比花青苷合成速率的降低對‘紅巴梨’的褪色作用更大。3.RT-qPCR分析與花青苷合成有關(guān)的結(jié)構(gòu)基因及轉(zhuǎn)錄因子在‘紅星’和‘紅巴梨’不同時(shí)期的表達(dá)情況,結(jié)果表明CHS、ANS、UFGT、MYB10和bHLH33是引起‘紅巴梨’果實(shí)發(fā)育后期花青苷含量降低的重要基因。4.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析鑒定出947個(gè)差異表達(dá)基因(Differentially Expressed Genes:DEGs),其中471個(gè)基因在‘紅巴梨’花后75天表達(dá)上調(diào),476個(gè)表達(dá)下調(diào);KEGG代謝通路分析將947個(gè)DEGs聚集94條KEGG代謝通路上,顯著性排名前五位依次為:光合作用、植物晝夜節(jié)律、過氧化物酶體、類黃酮物質(zhì)的合成、次生代謝產(chǎn)物的合成,其中,“次生代謝產(chǎn)物的合成”通路中富集的DEGs最多;利用Entrez數(shù)據(jù)庫對947個(gè)DEGs進(jìn)行功能注釋,篩選出61個(gè)可能與花青苷含量積累有關(guān)的DEGs,其中包括5個(gè)參與類黃酮物質(zhì)的合成,3個(gè)參與花青苷的降解,8個(gè)參與花青苷的轉(zhuǎn)運(yùn),其余全為轉(zhuǎn)錄因子MYB,bHLH,WRKY,NAC,ERF和zinc finger;另外還鑒定出7個(gè)與光信號有關(guān)的基因;RT-qPCR檢測12個(gè)候選基因的表達(dá)情況,結(jié)果與RNA-Seq一致。5.推測紅皮西洋梨‘紅巴梨’后期褪色與花青苷合成的減少、降解的增加、轉(zhuǎn)運(yùn)受阻及轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控作用關(guān)系密切,光信號也有可能參與其中。
[Abstract]:Color is an important appearance quality of pericarp. Due to its excellent quality, red pear is popular among consumers, but the problem of red fading of ripe fruit skin seriously affects its commodity value. Anthocyanin is the material basis for the formation of red pericarp. In order to determine the molecular mechanism of discoloration of red peel pear peel, the key genes of anthocyanin synthesis and extinction must be clarified. In this study, 'Pyrus communis L.', which is not fading in fruit development, was used in this study. And 'Pyrus communis L.' (Pyrus communis L.) In order to determine the anthocyanin content in different development stages of fruit, to analyze the changes of anthocyanin synthesis rate and degradation rate in fruit peel, and to select the peel material of 35 days after anthesis for transcriptional sequencing according to the changing pattern of anthocyanin content, and to analyze the changes of anthocyanin synthesis rate and degradation rate of anthocyanin in fruit peel. According to the results of fluorescence quantitative expression analysis, the candidate genes for red regression of 'Hongba pear' fruit peel were identified. The results are as follows: 1. At 55 days after anthesis, the content of anthocyanin reached the highest level, the content of anthocyanin in 'Hongba pear' decreased significantly but not significantly in the later stage of fruit development, and the content of anthocyanin in 'Hongba' was always lower than that of 'Hongxing' in the whole development period. Consistent with the color change of pericarp. 2. Before the peak period of anthocyanin (35-55 days after anthesis), the synthetic rate of anthocyanin was degraded, the accumulation of anthocyanin increased and maintained a high level, and after the peak of anthocyanin (55-75 days after anthesis), the synthesis rate of anthocyanin decreased significantly. The degradation rate of anthocyanin changed from accumulation mode to consumption mode and the content of anthocyanin decreased obviously. Therefore, the red regression of 'Hongba pear' fruit skin is caused by the decrease of anthocyanin synthesis rate and the increase of anthocyanin degradation rate. However, compared with the decrease of anthocyanin synthesis rate, the decolorization of 'Hongba pear' was more obvious. 3. RT-qPCR was used to analyze the expression of structural genes and transcription factors related to anthocyanin synthesis at different stages of 'Hongxing' and 'Hongba pear'. The results showed that CHSANSU UFGTMYB10 and bHLH33 were the important genes causing the decrease of anthocyanin content in 'Hongba pear' in the later stage of fruit development. 947 differentially expressed genes (genes: degs) were identified by transcriptome data analysis. Among them, 471 genes were up-regulated in 476 down-regulated KEGG metabolic pathways at 75 days after anthesis, and 947 degs were aggregated into 94 KEGG metabolic pathways. The top five were: photosynthesis, circadian rhythm of plants, peroxisome, synthesis of flavonoids, synthesis of secondary metabolites, among which, the most abundant DEGs were found in the pathway of "secondary metabolite synthesis". Using Entrez database to annotate 947 DEGs, 61 DEGss, including 5 involved in the synthesis of flavonoids, 3 involved in the degradation of anthocyanin, 8 involved in the transport of anthocyanin, were screened out. The rest were all transcription factors MYBB BHLHN WRKYYNACU ERF and zinc finger.The expression of 12 candidate genes was detected by RT-qPCR, and the results were in agreement with RNA-Seq .5.At the same time, 7 genes related to optical signal were detected by RT-qPCR. It is inferred that the fading of 'Hongba pear' is closely related to the decrease of anthocyanin synthesis, increase of degradation, inhibition of transport and regulation of transcription factors, and the light signal may also be involved in it.
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S661.2
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 王會良;何華平;龔林忠;王富榮;劉勇;諸小敏;;果樹中花青苷合成研究進(jìn)展[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年20期
2 齊建勛,郝艷賓,張玫,冷平;桃葉片中花青苷含量與葉綠素含量的相關(guān)關(guān)系[J];園藝學(xué)報(bào);2002年03期
3 李躍;劉延吉;;果實(shí)花青苷代謝機(jī)制及調(diào)控技術(shù)研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2007年16期
4 潘牧;雷尊國;鄧寬平;;彩色馬鈴薯花青苷研究進(jìn)展[J];農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊);2010年08期
5 張春雨;王晶瑩;郭慶勛;周連霞;賈承國;;越橘果實(shí)花青苷含量及其不同發(fā)育階段的變化[J];東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2012年04期
6 張茜;楊健;王龍;王蘇珂;李秀根;張紹鈴;;紅皮梨著色與花青苷合成研究進(jìn)展[J];果樹學(xué)報(bào);2012年04期
7 張茜;楊健;王龍;王蘇珂;李秀根;張紹鈴;;‘紅太陽’梨花青苷與可溶性糖的相關(guān)性分析及外源糖的增色作用研究[J];果樹學(xué)報(bào);2013年02期
8 王惠聰,黃旭明,胡桂兵,黃輝白;荔枝果皮花青苷合成與相關(guān)酶的關(guān)系研究[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2004年12期
9 鞠志國;;輪紋病菌侵染與蘋果花青苷的合成[J];萊陽農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào);1988年02期
10 傅友;溫度對蘋果花青苷合成的影響[J];河北果樹;1993年03期
相關(guān)會議論文 前6條
1 劉安成;李慧;王亮生;龐長民;;不同干燥方法對石榴果實(shí)花青苷的影響[A];中國植物園(第十四期)[C];2011年
2 牛姍姍;徐昌杰;張波;張望舒;李鮮;陳昆松;;楊梅花青苷合成及調(diào)節(jié)基因在三個(gè)不同色澤品種果實(shí)中的差異表達(dá)(摘要)[A];第二屆全國果樹分子生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2009年
3 王慶菊;呂福梅;沈向;;四種李屬紅葉樹種葉片花青苷提取及穩(wěn)定性研究[A];中國園藝學(xué)會第七屆青年學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2006年
4 馮立娟;苑兆和;尹燕雷;招雪晴;;‘紅葉短枝'衛(wèi)矛變色期葉片中花青苷含量及其合成相關(guān)酶活性變化的研究[A];中國觀賞園藝研究進(jìn)展2012[C];2012年
5 田鵬;魏聞東;蘇艷麗;;紅太陽果實(shí)花青苷含量、pH和SSC變化及相關(guān)性研究[A];梨科研與生產(chǎn)進(jìn)展(五)[C];2011年
6 胡桂兵;王惠聰;高飛飛;陳大成;;套袋過程中荔枝果皮內(nèi)色素的變化動態(tài)[A];中國園藝學(xué)會第五屆青年學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2002年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條
1 魏海蓉;甜櫻桃果實(shí)花青苷形成的生理生化與轉(zhuǎn)錄組分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
2 張蕊芬;蘋果SUMO E3連接酶MdSIZ1調(diào)控逆境應(yīng)答和花青苷積累的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
3 錢敏杰;DNA甲基化和microRNA調(diào)控紅梨果皮著色的機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2017年
4 姜永華;轉(zhuǎn)錄因子MdHB1調(diào)控'澳洲青蘋'蘋果花青苷合成的分子機(jī)制研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2017年
5 馮守千;紅梨著色機(jī)理的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
6 張潔;四種觀賞植物花青苷分析及其花色形成機(jī)制[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2011年
7 馮新新;5-氨基乙酰丙酸誘導(dǎo)蘋果花青苷積累機(jī)理的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
8 劉玉蓮;不同色澤類型蘋果著色期糖酸變化及花青苷合成特性研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2013年
9 陳靜;花青苷對番茄(Lycopersicon esculentum Mill.)幼苗葉片光合機(jī)構(gòu)的保護(hù)作用及番茄花青苷結(jié)構(gòu)特性的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2005年
10 俞波;紅色砂梨花青苷生物合成相關(guān)基因分離及表達(dá)研究[D];浙江大學(xué);2012年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 吳然;蘋果銹果類病毒的時(shí)空分布規(guī)律及對花青苷合成和相關(guān)基因的影響[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
2 陳磊;采前ALA/GNT處理和氣調(diào)貯藏方式對蘋果花青苷及相關(guān)基因表達(dá)的影響[D];陜西師范大學(xué);2015年
3 李霞;施鉀對紫甘薯塊根花青苷積累的影響[D];江蘇師范大學(xué);2014年
4 孫志偉;桃果肉中花青苷合成相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因MYB的克隆及其表達(dá)分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
5 葛翠蓮;紅肉獼猴桃果肉色澤變化及花青苷合成相關(guān)基因的克隆與表達(dá)[D];江西農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
6 王智敏;紅梨果皮著色相關(guān)R2R3型MYB轉(zhuǎn)錄因子基因功能分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年
7 高s,
本文編號:2114987
本文鏈接:http://www.sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/2114987.html