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芒果ANR基因的克隆及其表達分析

發(fā)布時間:2018-07-05 16:41

  本文選題:芒果 + 原花青素; 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年04期


【摘要】:花青素還原酶(anthocyanidin reductase,簡稱ANR)基因是植物產(chǎn)生原花青素的關(guān)鍵基因,對于研究原花青素的代謝有重要的作用。根據(jù)已經(jīng)報道的ANR基因的序列設(shè)計兼并引物,采用3'c DNA末端快速擴增(3'RACE)、5'c DNA末端快速擴增(5'RACE)方法,從芒果果實內(nèi)克隆到1個ANR基因,其全長c DNA序列為1 201 bp。該基因開放閱讀框為1 008 bp,編碼335個氨基酸,等電點為5.41,分子量為36.33 ku。對基因組擴增得到了1 810 bp長度的片段,分析發(fā)現(xiàn),該基因含有5個內(nèi)含子,內(nèi)含子位置分別為130~646 bp、733~814 bp、1 017~1 080 bp、1 259~1 349 bp、1 563~1 651 bp。通過系統(tǒng)發(fā)育樹分析發(fā)現(xiàn),該基因編碼的蛋白與可可、葡萄等果樹具有較近的親緣關(guān)系。對不同芒果品種中ANR基因的表達進行分析發(fā)現(xiàn),該基因在綠色的桂七品種中表達量較高,而在紅色的貴妃品種中表達量較低。
[Abstract]:Anthocyanin reductase (anthocyanidin reductase,) gene is the key gene for proanthocyanidins production in plants and plays an important role in the study of proanthocyanidins metabolism. According to the reported sequence of ANR gene, a degenerate primer was designed and cloned from mango fruit by rapid amplification (3race) and rapid amplification (5race). The full-length cDNA sequence of ANR gene was 1 201 BP. The open reading frame of the gene is 1 008 BP, encoding 335 amino acids, the isoelectric point is 5.41, and the molecular weight is 36.33 ku. The length of 1 810 BP fragment was obtained by genomic amplification. It was found that the gene contained 5 introns, the position of which was 130 ~ 646 BP ~ 733 ~ 814 BP ~ (1 017) ~ 1 080 BP ~ 1 259N ~ (1 349) BP ~ (1 349) BP ~ 1 563N ~ (1 651) BP respectively. Phylogenetic tree analysis showed that the protein encoded by the gene was closely related to the fruit trees such as cocoa and grape. The expression of ANR gene in different mango varieties was analyzed. It was found that the expression of ANR gene was higher in the green seven cultivars than in the red ones.
【作者單位】: 荊楚理工學(xué)院生物工程學(xué)院;中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物品種資源研究所/農(nóng)業(yè)部華南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點開發(fā)實驗室;國家熱帶果樹品種改良中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(編號:31471850) 農(nóng)業(yè)部熱帶作物種質(zhì)資源保護(編號:15RZZY-07);農(nóng)業(yè)部“948”計劃(編號:2011-G13) 湖北省荊門市科技局項目(編號:110588)
【分類號】:S667.7

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