芥菜型油菜B03染色體黃籽基因區(qū)域BAC重疊群的構(gòu)建及分析
本文選題:芥菜型油菜 + 黃籽基因。 參考:《作物研究》2016年04期
【摘要】:在前人研究中,芥菜型黃籽基因被定位到B03連鎖群的1.5 c M區(qū)域內(nèi)。本試驗(yàn)利用與B03染色體控制黃籽基因區(qū)域緊密連鎖的unigene(通過(guò)RNA_seq技術(shù)獲得的芥菜型油菜種皮的非冗余基因)和BESs開(kāi)發(fā)標(biāo)記,并對(duì)芥菜型油菜作圖群體親本紫葉芥BAC文庫(kù)(ZBju H BAC文庫(kù))進(jìn)行篩選,由開(kāi)發(fā)的320對(duì)引物共篩到BAC920個(gè),對(duì)其中483個(gè)BACs進(jìn)行了末端測(cè)序,返回序列860條。構(gòu)建了6段芥菜型油菜B03染色體黃籽區(qū)域BAC重疊群,共計(jì)長(zhǎng)約3.3 Mb;通過(guò)BES blast分析表明,在B03染色體黃籽區(qū)域與A03、A09染色體存在高度的重復(fù)序列。
[Abstract]:In previous studies, the mustard yellow seed gene was located in the 1.5 cm region of the B03 linkage group. In this study, we used Unigene (non-redundant gene of Brassica napus seed coat obtained by RNAseq technique) and BESs to develop markers, which are closely linked to the region of yellow seed gene controlled by B03 chromosome. The BAC library of parent purple leaf mustard was screened from 320 pairs of primers to BAC920, of which 483 BACs were sequenced and 860 sequences were returned. A total of 3. 3 Mb. BAC overlapped group was constructed in the yellow seed region of B03 chromosome of Brassica napus B03. The results of BES blast analysis showed that there was a high repeat sequence between the yellow seed region of chromosome B03 and chromosome A03 A09.
【作者單位】: 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)油料作物研究所;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(30471098)
【分類(lèi)號(hào)】:S565.4
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,本文編號(hào):2031247
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