本文選題：割手密 + 基因克隆��； 參考：《廣西植物》2017年03期

【摘要】：該研究從甘蔗細(xì)莖野生種(割手密Saccharum spontaneum)中克隆抗旱相關(guān)的基因Sc ALDH,并分析其在干旱處理?xiàng)l件下的表達(dá)情況和序列特征。利用RT-PCR技術(shù)克隆甘蔗的ALDH基因片段,并對(duì)其核苷酸和氨基酸序列進(jìn)行分析。使用NCBI Blastx、ORF finder、Mega、NCBI Conserved Domain Search等程序?qū)ζ浞謩e進(jìn)行不同物種氨基酸比較、開(kāi)放閱讀框(ORF)尋找、進(jìn)化樹(shù)及保守序列分析,并用Real Time-PCR分析所克隆基因在干旱脅迫前后的表達(dá)差異。結(jié)果表明:克隆出甘蔗的ALDH基因片段,總長(zhǎng)度為1996bp,其中蛋白質(zhì)編碼區(qū)(CDS)全長(zhǎng)1524bp,編碼508個(gè)氨基酸;與其它物種ALDH類蛋白氨基酸序列有很高的同源性,有ALDH家族的保守序列,并含有完整的開(kāi)放閱讀框,系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析顯示與玉米的蛋白質(zhì)親緣關(guān)系最近;Real timePCR數(shù)據(jù)表明,在干旱脅迫下,隨著干旱時(shí)間的延長(zhǎng),該基因的表達(dá)量呈持續(xù)積累的表達(dá)模式。總體上來(lái)說(shuō),該基因?qū)Ω珊得{迫顯著表達(dá)。利用RT-PCR技術(shù)克隆的甘蔗ALDH基因,屬于ALDH蛋白家族的一員,具有其典型的功能域,該基因在干旱脅迫過(guò)程中參與抗旱作用。該研究結(jié)果為野生種資源開(kāi)發(fā)、優(yōu)良抗旱親本選擇和培育抗旱性強(qiáng)甘蔗品種提供了參考依據(jù)。
[Abstract]:In this study, the drought-related gene SC ALDH was cloned from wild sugarcane fine stem species (Saccharum spontaneum), and its expression and sequence characteristics under drought treatment were analyzed. The ALDH gene fragment of sugarcane was cloned by RT-PCR and its nucleotide and amino acid sequences were analyzed. The amino acids of different species were compared by using NCBI Blastx ORF finder Conserved Domain Search and other programs. Open reading frame (ORF) search, phylogenetic tree and conserved sequence analysis were used to analyze the difference of expression of cloned genes before and after drought stress by Real Time-PCR. The results showed that the total length of ALDH gene of sugarcane was 1996bp.The length of protein coding region was 1524bp, encoding 508 amino acids, which had high homology with other species ALDH protein amino acid sequence and conserved sequence of ALDH family. The phylogenetic tree analysis showed that the protein phylogenetic relationship with maize was closely related to Real timePCR data. The results showed that under drought stress, the expression of the gene showed a continuous accumulation pattern with the prolongation of drought time. In general, the gene was significantly expressed under drought stress. The sugarcane ALDH gene cloned by RT-PCR technique is a member of the ALDH protein family and has its typical functional domain. The gene is involved in drought resistance during drought stress. The results provided a reference basis for the exploitation of wild species, the selection of fine drought-resistant parents and the cultivation of sugarcane varieties with strong drought resistance.
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31560417) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究重點(diǎn)項(xiàng)目(2015FA024) 云南省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)甘蔗產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)項(xiàng)目(2009-2015) 云南省重點(diǎn)新產(chǎn)品開(kāi)發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2012BB014) 云南省高原山地作物可持續(xù)生產(chǎn)系統(tǒng)研究創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(云科人發(fā)[2012]18號(hào))~~
【分類號(hào)】：Q943.2;S566.1

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本文編號(hào)：1963761