本文選題：馬身豬 + MEFA基因　； 參考：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年04期

【摘要】：本研究旨在克隆馬身豬肌細胞增強因子2A(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)基因的不同剪接體類型。依據(jù)轉錄組測序對可變剪接的預測結果,試驗擴增MEF2A基因第5~8外顯子之間的編碼區(qū),用生物信息學軟件分析了馬身豬MEF2A基因不同剪接體的序列特性,預測保守結構域,構建系統(tǒng)進化樹,比對不同物種MEF2A的氨基酸同源性。結果顯示,獲得了4個MEF2A基因的剪接體,MEF2A1的第5~8外顯子正常剪接;MEF2A2缺失了第5外顯子,第6外顯子的5′端多出138bp,第7外顯子的3′端多出102bp;MEF2A3缺失了第5外顯子,第6外顯子的5′端多出138bp;MEF2A4第7外顯子的3′端多出102bp。插入的138bp序列編碼的蛋白質中存在1個保守結構域HJURP_C,這可能與MEF2A參與肝細胞纖維化作用有關。MEF2A1和MEF2A4與豬MEF2A1(GenBank登錄號:NP_001090890.1)同屬于一個亞群,同源性高達98.9%,MEF2A2和MEF2A3與豬MEF2A2(GenBank登錄號:NP_001093168.1)同屬于一個亞群,同源性分別為98.2%和98.9%。本試驗成功克隆了4個MEF2A基因的剪接體,為進一步研究其蛋白功能奠定基礎。
[Abstract]:The aim of this study was to clone different splicing types of myocyte enhancer 2A(myocyte enhancer factor 2 An MEF 2 A gene. Based on the prediction of variable splicing by transcriptome sequencing, the coding region between exon 5 of MEF2A gene was amplified. The sequence characteristics of different splicing bodies of MEF2A gene were analyzed by bioinformatics software, and the conserved domain was predicted. Phylogenetic tree was constructed to compare the amino acid homology of MEF2A in different species. The results showed that exon 5, exon 5 in exon 5, exon 5 The 5'end of exon 6 was 102bpmore than the 3'end of exon 7 of MEF2A4. There is a conserved domain HJURP C in the protein encoded by the inserted 138bp sequence, which may be related to the involvement of MEF2A in hepatocyte fibrosis. MEF2A1 and MEF2A4 belong to the same subgroup as MEF2A1(GenBank accession number: NP001090890.1. The homology of MEF2A2 and MEF2A3 were 98.2% and 98.9%, respectively, which belonged to the same subgroup as Pig MEF2A2(GenBank accession number: NP00103168.1). In this study, four splicing bodies of MEF2A gene were cloned successfully, which laid a foundation for further study of its protein function.
【作者單位】： 山西農業(yè)大學動物科技學院;
【基金】：山西省科技創(chuàng)新重點團隊項目(201605D131045-24) 三晉學者項目(2016) 山西省農業(yè)科技攻關項目(20140311020-5) 山西省高等學校優(yōu)秀青年學術帶頭人項目
【分類號】：Q78;S828

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本文編號：1952514