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阿特拉津降解菌Enterobacter sp.的基因差異分析

發(fā)布時(shí)間:2018-05-27 07:36

  本文選題:生物降解 + 阿特拉津; 參考:《科學(xué)技術(shù)與工程》2017年27期


【摘要】:篩選并分析生物降解菌Enterobacter sp.在阿特拉津作用下的差異基因。以Enterobacter sp.BIDMC 29基因組為參考,利用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)阿特拉津降解菌株和對(duì)照菌株進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。結(jié)果表明,共有368個(gè)基因表現(xiàn)出顯著差異,其中上調(diào)基因231個(gè),下調(diào)基因137個(gè)。在差異基因GO富集分析的前30個(gè)條目中,尿嘧啶分解代謝、氮利用、硝酸鹽同化、硫化氫生物合成、裂解酶活性和過(guò)氧化物酶活性等相關(guān)基因表現(xiàn)富集。Pathway分析顯示,差異基因涉及70條代謝途徑,與氮代謝、氨基酸合成和代謝、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、丙酮酸代謝等過(guò)程有關(guān)。菌株通過(guò)調(diào)節(jié)基因表達(dá)來(lái)提高對(duì)阿特拉津的降解能力,為進(jìn)一步解析阿特拉津的代謝機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Screening and analysis of biodegradable bacteria Enterobacter sp. Differentially expressed genes in the presence of atrazine. The transcriptome sequencing of atrazine degrading strain and control strain was carried out by high throughput sequencing with Enterobacter sp.BIDMC 29 genome as reference. The results showed that 368 genes showed significant differences, including 231 up-regulated genes and 137 down-regulated genes. Among the first 30 items in differential gene go enrichment analysis, uracil catabolism, nitrogen utilization, nitrate assimilation, hydrogen sulfide biosynthesis, lyase activity and peroxidase activity showed enrichment. Differentially expressed genes involve 70 metabolic pathways related to nitrogen metabolism amino acid synthesis and metabolism of ABC transporter and pyruvate metabolism. The strain could improve the degradation ability of atrazine by regulating gene expression and lay a foundation for further analysis of atrazine metabolism mechanism.
【作者單位】: 沈陽(yáng)化工大學(xué)環(huán)境與安全工程學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31400481) 遼寧省博士科研啟動(dòng)項(xiàng)目(20141086)資助
【分類號(hào)】:X172

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本文編號(hào):1941088

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