發(fā)布時間：2018-05-21 18:16

  本文選題：易感基因 + 高通量測序　； 參考：《中國內(nèi)鏡雜志》2017年07期

【摘要】：目的采用高通量測序技術通過對膽囊結石復發(fā)患者膽囊黏膜中基因表達譜的檢測及生物信息學的分析,初步了解基因在膽囊結石發(fā)生發(fā)展中的作用機制。方法用Illumina Hi Seq 2500新一代高通量測序技術對7例膽囊結石及2例膽囊息肉復發(fā)患者進行mRNA表達譜差異篩選分析,并對得到的數(shù)據(jù)進行Gene Ontology(GO)和京都基因與基因組(KEGG)顯著性富集統(tǒng)計。結果高通量測序結果顯示,差異表達的mRNA差異基因共有150條。通過GO功能顯著性富集分析,發(fā)現(xiàn)分子功能的GO功能顯著富集是抗原結合;而對于生物過程,富集的GO功能是免疫應答;對于細胞成分,富集的GO功能是細胞外區(qū)域。KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn)最顯著的途徑是細胞因子-細胞因子受體作用途徑(P=0.000)。結論目前的研究表明,研究膽囊結石復發(fā)易感基因,可以為預防內(nèi)鏡保膽術后膽囊結石復發(fā)的科學研究工作及臨床治療提供一個重要的參考。
[Abstract]:Objective to investigate the mechanism of gene expression in gallbladder gallstone by high-throughput sequencing technique by detecting gene expression profile and bioinformatics analysis in gallbladder mucosa of patients with gallstone recurrence. Methods Illumina Hi Seq 2500 high-throughput sequencing technique was used to screen and analyze the differential expression profiles of mRNA in 7 patients with gallstone and 2 patients with recurrent polyps of gallbladder. The data obtained were analyzed by Gene Ontology (GOG) and the significant enrichment statistics of Kyoto gene and genomic KEGG. Results High throughput sequencing showed that there were 150 differentially expressed mRNA genes. Through the analysis of go functional significance enrichment, it is found that the go function enrichment of molecular function is antigen binding, while for biological process, the enriched go function is immune response. Enriched go function is extracellular region. KEGG pathway enrichment analysis found that the most significant pathway is the cytokine-cytokine receptor pathway Pu 0.000. Conclusion the present study indicates that the study of the susceptible gene of gallstone recurrence can provide an important reference for the scientific research and clinical treatment of preventing the recurrence of gallstone after endoscopic cholecystectomy.
【作者單位】： 河北省保定市第二醫(yī)院肝膽外科;
【分類號】：R575.62

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本文編號：1920244