本文選題：結球甘藍 + SET結構域基因�。� 參考：《安徽農業(yè)大學》2016年碩士論文

【摘要】：結球甘藍(Brassica oleracea Linn.var.capitata DC),簡稱甘藍,屬于十字花科(Cruciferae)蕓薹屬(Brassica)的兩年生草本植物,世界各地均有栽培,是一種重要的葉用蔬菜類作物。植物生長發(fā)育過程中存在著保守的表觀遺傳調控機制,其中最重要的一種組蛋白修飾就是賴氨酸組蛋白甲基化,主要由一類含有SET結構域的基因家族修飾,在真核生物中廣泛存在。植物SET結構域基因功能復雜,它們參與蛋白甲基化,影響染色體的濃縮和分離以調控染色體結構,還參與基因的轉錄調節(jié)、調控基因表達等眾多的細胞反應過程,對植物的生長發(fā)育起著重要的作用。本研究通過生物信息學分析方式,對SET結構域基因家族的基本信息(長度、分子量、等電點等)及染色體定位、結構域分布、基因結構、基因的系統(tǒng)進化等進行分析。同時,對SET結構域基因在結球甘藍“Bo01-12B”不同發(fā)育時期、不同器官中的時空表達圖譜進行分析。結果表明:1.結球甘藍基因組中共有29條SET結構域基因,這些基因不均勻的分布在甘藍9條染色體上,尤其1號染色體上沒有SET結構域基因。29條SET結構域基因開放閱讀框及編碼的蛋白長度各異,最長的Bol027564基因開放閱讀框長5,088bp,編碼1,695氨基酸殘基,而最短Bol044707基因開放閱讀框為405 bp,編碼134氨基酸殘基。從基因結構來看,內含子最少有0個,最多超過20個。其中16條SET結構域蛋白呈堿性。2.結球甘藍中SET結構域基因的系統(tǒng)進化分析,結合其他保守結構域的分布,甘藍中29條SET結構域基因家族可分為7個分支。第I分支保守結構域模型為SANT-SET,第II分支保守結構域模型為AWS-SET-post-SET,第III分支保守結構域模型為PWWP-PHD-PHD-SET-post-SET,第IV分支保守結構域模型為PHD-SET,第V分支保守結構域模型為SRA-pre-SET-SET,第VI分支的結構域模型為SET-post-SET,第VII分支只含有SET一個結構域。3.7條SET結構域基因(Bol040761,Bol030053,Bol042363,Bol043727,Bol025176,Bol027607,Bol011910)在結球甘藍的熒光定量表達分析表明,SET結構域基因在根、莖、花蕾、花中均有表達,在葉中不表達。其中在花蕾中表達量最高,根中次之。在不同發(fā)育時期花蕾的半定量表達分析中,SET結構域基因普遍在花粉母細胞時期高度表達。
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【學位授予單位】：安徽農業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S635.1

【參考文獻】

相關期刊論文 前4條

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本文編號：1897906