基于NRPSs基因篩選與鑒定海蘆筍內(nèi)生細(xì)菌
本文選題:內(nèi)生細(xì)菌 + 分離鑒定; 參考:《食品與發(fā)酵工業(yè)》2017年09期
【摘要】:利用形態(tài)學(xué)觀察和分子生物學(xué)相結(jié)合的方法分離鑒定海蘆筍內(nèi)生細(xì)菌,并篩選含有NRPS基因的菌株(nonribosomal peptide synthetase,NRPS),以期獲得能夠產(chǎn)生環(huán)肽化合物的菌株。研究結(jié)果表明,共從海蘆筍中分離到6株內(nèi)生細(xì)菌Srtli-F1~Srtli-F6,分別鑒定為綠針假單胞菌橙黃亞種(Pseudomonas chlororaphis subsp.aurantiaca)、組氨酸節(jié)桿菌(Arthrobacter histidinolovorans)、慶盛芽孢桿菌(Bacillus qingshengii)、類芽孢桿菌羽扇豆根瘤菌(Paenibacillus lupini)、假蕈狀芽孢桿菌(Bacillus pseudomycoides)、高山麝病原性阿爾伯蒂埃希氏桿菌(Escherichia albertii),其中菌株Srtli-F5檢測到含有NRPS基因,經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育樹分析,預(yù)測該菌株可能產(chǎn)生環(huán)肽類化合物,該株菌經(jīng)過發(fā)酵,有機(jī)溶劑萃取發(fā)酵產(chǎn)物,并用電噴霧質(zhì)譜ESI-MS(electrospray mass,ESI-MS)分析Srtli-F5能產(chǎn)生環(huán)肽化合物——桿菌肽,證實(shí)了該預(yù)測結(jié)果。該研究為定向篩選能夠產(chǎn)生環(huán)肽類化合物的菌種開拓了新思路。
[Abstract]:Using the method of combining morphological observation and molecular biology to isolate and identify the endophytic bacteria of asparagus asparagus, and screening the strains containing NRPS gene (nonribosomal peptide synthetase, NRPS), in order to obtain the strains capable of producing cyclic peptide compounds. The results showed that 6 strains of endophytic bacteria Srtli-F1~Srtli-F6 were isolated from the asparagus sea asparagus, respectively. Identified as Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas chlororaphis subsp.aurantiaca), histidine Arthrobacter (Arthrobacter histidinolovorans), Bacillus subtilis (Bacillus qingshengii), Bacillus lupus lupus Rhizobium (Paenibacillus lupini), Bacillus Mycosis (Bacillus pseudomycoides), Alpine Musk. The strain Srtli-F5 (Escherichia albertii), in which the strain Srtli-F5 detected the NRPS gene, was analyzed by phylogenetic tree and predicted that the strain could produce cyclo peptides. The strain was fermented by fermentation, the fermentation product was extracted by organic solvent, and the cyclic peptide could be produced by the electrospray ionization mass spectrometry ESI-MS (electrospray mass, ESI-MS). The bacilli peptide has confirmed the prediction results. This research has opened up a new way for screening strains that can produce cyclones.
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院;
【基金】:2017年農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全風(fēng)險(xiǎn)評估項(xiàng)目(GJFP201701102) 2016年南京農(nóng)業(yè)大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計(jì)劃(SRT)項(xiàng)目(1618C01)
【分類號(hào)】:TS201.3
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,本文編號(hào):1895654
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