灰飛虱雌激素相關受體基因的克
本文選題:灰飛虱 + 雌激素相關受體; 參考:《昆蟲學報》2017年03期
【摘要】:【目的】雌激素相關受體(estrogen-related receptor,ERR)是一類依賴配體激活的轉(zhuǎn)錄因子,能感受外源物質(zhì)脅迫調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄,參與外源物質(zhì)的代謝過程。本研究旨在通過克隆灰飛虱Laodelphax striatellus ERR基因,分析其序列和在氟啶蟲胺腈脅迫下表達譜,探析其生理功能及在殺蟲劑代謝中的作用!痉椒ā扛鶕(jù)灰飛虱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息,利用RT-PCR克隆灰飛虱ERR基因,并進行生物信息學分析;通過實時熒光定量PCR,分析暴露于氟啶蟲胺腈(0.76 ng/頭)后,灰飛虱4齡若蟲ERR基因在不同時間點和不同組織中的表達量!窘Y(jié)果】從灰飛虱中克隆到ERR基因,命名為Ls ERR(Gen Bank登錄號:KY210878),其c DNA序列全長1 854 bp,開放閱讀框長1 260 bp,編碼419個氨基酸,預測編碼蛋白的分子量為47.70 k D。序列分析顯示,Ls ERR具有核受體(nuclear receptors,NRs)家族成員的共同特征性結(jié)構(gòu):DNA結(jié)合區(qū)(DNA-binding domain,DBD)(第75-168位氨基酸)和配體結(jié)合區(qū)(ligand-binding domain,LBD)(第194-416位氨基酸)。采用APSSP2法預測Ls ERR蛋白二級結(jié)構(gòu),其中α螺旋占43.53%,β折疊占5.49%,無規(guī)則卷曲占50.98%。其中,在DBD區(qū),有6個β折疊和3個α螺旋;在LBD區(qū),有3個β折疊和11個α螺旋。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,Ls ERR與褐飛虱Nilaparvata lugens ERR親緣關系最近;绎w虱4齡若蟲暴露于氟啶蟲胺腈后,12 h時其體內(nèi)Ls ERR基因上調(diào)表達,24 h時達到表達高峰,48 h時表達量下調(diào);Ls ERR在頭部微弱表達,在腹部特異性高表達!窘Y(jié)論】Ls ERR是參與灰飛虱代謝氟啶蟲胺腈的候選基因。本研究為解毒酶基因的調(diào)控和新分子靶標農(nóng)藥的研制提供分子基礎。
[Abstract]:[objective] estrogen-related receptor ERR (ERR) is a ligand-activated transcription factor, which can regulate the transcription of target gene and participate in the metabolism of exogenous substance. The purpose of this study was to clone the Laodelphax striatellus ERR gene of planthopper, analyze its sequence and expression profile under flurazidonitrile stress, and explore its physiological function and its role in insecticide metabolism. [methods] according to the information of transcriptome data of fly planthopper, The ERR gene was cloned by RT-PCR and analyzed by bioinformatics. The expression of ERR gene of 4th instar nymph in different time points and in different tissues. [results] ERR gene was cloned from the plant planthopper. The c DNA sequence is 1 854 BP in length, and the open reading frame is 1 260 BP, encoding 419 amino acids. The predicted molecular weight of the encoded protein is 47.70 KD. Sequence analysis showed that the ERR had the common characteristic structure of the nuclear receptor NRs1 family members. The DNA binding domain of ERR was the 75-168 amino acids and the ligand binding domain of ligand binding domain LBDD (the 194-416 amino acid). The secondary structure of Ls ERR protein was predicted by APSSP2 method. 偽 helix accounted for 43.53%, 尾 fold for 5.49% and irregular crimp for 50.98%. Among them, there are 6 尾 folds and 3 偽 helix in DBD region and 3 尾 fold and 11 偽 helix in LBD region. Phylogenetic analysis showed that ERR had the closest relationship with Nilaparvata lugens ERR. The expression of Ls ERR gene in the 4th instar nymphs was down-regulated at 24 h after exposure to fludiconitrile and reached the peak at 48 h after exposure to fludiconitrile. [conclusion] Ls ERR is a candidate gene involved in the metabolism of fluazolidonitrile in planthopper. This study provides a molecular basis for the regulation of detoxifying enzyme gene and the development of new molecular target pesticides.
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所;南京農(nóng)業(yè)大學植物保護學院農(nóng)作物生物災害綜合治理教育部重點實驗室;淮北師范大學生命科學學院;
【基金】:江蘇省自然科學基金項目(BK20150539) 國家科技支撐計劃課題(2012BAD14B12-5) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金(CX(15)1004) 農(nóng)作物生物災害綜合治理教育部重點實驗室開放課題基金(IMCDP201603)
【分類號】:Q78;S433
【參考文獻】
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【共引文獻】
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,本文編號:1849639
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