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Affymetrix基因表達譜芯片技術(shù)篩選胰腺癌異常表達基因的研究

發(fā)布時間:2018-04-18 11:29

  本文選題:胰腺腫瘤 + 基因表達譜; 參考:《中國普通外科雜志》2017年03期


【摘要】:目的:利用基因表達譜芯片篩選出胰腺癌組織與癌旁正常組織的差異表達基因。方法:收集新疆醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院2014年1月—2016年6月間手術(shù)切除的10例胰腺導(dǎo)管細胞癌組織及其相應(yīng)癌旁正常組織,用TRIzol法提取總RNA后采用含49395個基因探針的Affymetrix基因表達譜芯片篩選出差異表達基因,并行GO分析和pathway分析,對部分差異表達基因行實時定量PCR法驗證表達情況。結(jié)果:樣本總RNA檢測合格,基因芯片質(zhì)量評估良好,檢測結(jié)果可靠且可重復(fù)性高。經(jīng)芯片降噪處理后共檢測38079個基因,其中存在差異表達的基因共512個,表達上調(diào)的基因419個,表達下調(diào)的基因93個;共287個差異表達基因編碼與3個GO分類(生物學(xué)過程、分子功能、細胞組分)相關(guān)的蛋白;共29條信號通路存在明顯基因差異表達,涉及126個基因。經(jīng)PCR驗證,差異表達基因CPB1、CELA3B、CPA1、POSTN、PLA2G1B、CTRC及SPINK1的表達情況與基因芯片檢測結(jié)果吻合。結(jié)論:胰腺導(dǎo)管細胞癌組織與癌旁正常組織間存在大量差異表達的基因,這些基因主要與生物學(xué)過程、分子功能及細胞組分相關(guān),且參與了多個細胞信號通路的調(diào)控。
[Abstract]:Objective : To investigate the expression of differentially expressed genes in pancreatic ductal carcinoma tissues and adjacent normal tissues by gene expression profiling . The results showed that there were a number of differentially expressed genes in pancreatic ductal carcinoma tissues from January 2014 to June 2016 .

【作者單位】: 新疆醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院肝膽外科;新疆醫(yī)科大學(xué)第五附屬醫(yī)院醫(yī)務(wù)部;廣東省深圳市羅湖區(qū)人民醫(yī)院普通外科;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(81360328)
【分類號】:R735.9

【參考文獻】

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【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號:1768219

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