本文選題：富含亮氨酸的重復(fù)序列(LRR) + 色氨酸-天冬氨酸重復(fù)序列(WD)��； 參考：《云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué))》2017年01期

【摘要】：LRWD1基因在精子形成過程中起重要作用。從Gen Bank下載豬及近緣物種的LRWD1 mRNA序列作為參考序列,設(shè)計特異引物擴(kuò)增版納微型豬近交系(BMI)LRWD1基因。對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行功能生物信息學(xué)分析,構(gòu)建多物種系統(tǒng)進(jìn)化樹。研究獲得了BMI LRWD1 1 944 bp的編碼區(qū)序列(Gen Bank登錄號:KU705639,對應(yīng)的氨基酸登錄號:AOC89057),編碼647個氨基酸,蛋白質(zhì)分子量(Mw)為71.40 k D,等電點(diǎn)(p I)為7.52。功能生物信息學(xué)分析表明LRWD1蛋白質(zhì)存在2個保守結(jié)構(gòu)域,無跨膜結(jié)構(gòu),無信號肽序列;N末端和C末端均疏水;有6類功能活性位點(diǎn),位于細(xì)胞質(zhì)的概率是70.6%。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,BMI與狗、大熊貓的親緣關(guān)系最近。研究結(jié)果將為進(jìn)一步研究LRWD1基因在豬精子發(fā)生方面的作用及功能奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:LRWD1 gene plays an important role in spermatogenesis.The LRWD1 mRNA sequence of porcine and related species was downloaded from Gen Bank as reference sequence, and specific primers were designed to amplify the LRWD1 gene of BMIN mini-pig inbred line BMIWD1.The functional bioinformatics analysis of protein sequences was carried out to construct the phylogenetic tree of multiple species.The coding region sequence of BMI LRWD1 1,944bp was obtained. The accession number of Gen Bank was: KU705639, the corresponding amino acid login number was: AOC89057, encoding 647 amino acids, the molecular weight of protein was 71.40kD, and the isoelectric point was 7.52.Functional bioinformatics analysis showed that LRWD1 protein had two conserved domains, no transmembrane structure, no signal peptide sequence, both N-terminal and C-terminal hydrophobic, and there were six functional active sites, the probability of being located in cytoplasm was 70.6.Phylogenetic analysis showed that BMI had the closest relationship with dogs and giant pandas.The results will lay a foundation for further study on the role and function of LRWD1 gene in porcine spermatogenesis.
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)云南省版納微型豬近交系重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;云南省家畜改良工作站;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31660637,31460580,31660650)
【分類號】：S828.2

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本文編號：1741949