珙桐轉錄因子DiMYB1基因的生物信息學分析
發(fā)布時間:2018-04-02 23:33
本文選題:DiMYB 切入點:珙桐 出處:《北方園藝》2017年02期
【摘要】:利用生物信息學方法對前期通過轉錄組測序獲得的珙桐DiMYB1基因編碼蛋白序列進行分析,為后續(xù)DiMYB1基因的功能鑒定和調(diào)控研究奠定基礎。結果表明:DiMYB1蛋白全長924bp,編碼307個氨基酸,相對分子量為35kDa,為親水性蛋白。DiMYB1屬于R2R3-MYB蛋白家族,含有1個信號肽結構和2個功能結構域,亞細胞定位預測該基因位于細胞核的可能性是91.3%。系統(tǒng)進化樹分析表明,其與柿樹MYB2轉錄因子的同源性最高,相似度為84%。
[Abstract]:Bioinformatics was used to analyze the coding protein sequence of DiMYB1 gene of Davidia involucrata by transcriptional sequencing, which laid a foundation for the functional identification and regulation of DiMYB1 gene.The results showed that the total length of the protein was 924 BP, encoding 307 amino acids, and the relative molecular weight was 35 kDa.DiMYB1 was a hydrophilic protein belonging to the R2R3-MYB family, which contained a signal peptide structure and two functional domains.The possibility of subcellular localization predicting that the gene is located in the nucleus is 91. 3%.Phylogenetic tree analysis showed that it had the highest homology with MYB2 transcription factors and the similarity was 84%.
【作者單位】: 中南林業(yè)科技大學生命科學與技術學院;
【基金】:中南林業(yè)科技大學博士后科研基金資助項目(0490016);中南林業(yè)科技大學青年基金資助項目(QJ201512)
【分類號】:S792.99
【相似文獻】
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本文編號:1702632
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