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綿羊IGF-Ⅰ基因剪接異構體克隆及生物信息學分析

發(fā)布時間:2018-03-24 03:10

  本文選題:動物遺傳育種與繁殖 切入點:綿羊 出處:《中國科技論文》2017年12期


【摘要】:胰島素樣生長因子-1(insulin like growth factor I,IGF-Ⅰ)是機體重要的生長因子,可作為培育高產、優(yōu)質的毛用、肉用家畜新品種時重要的候選基因,但其在轉錄過程中存在著選擇性剪接現(xiàn)象。本研究成功克隆得到了綿羊IGF-Ⅰ基因Ⅰ類Ea型和Eb型兩種剪接異構體,并結合生物信息學方法對其結構與功能進行分析。研究結果表明,克隆得到的綿羊IGF-Ⅰ基因Ⅰ類Ea型與GenBank數(shù)據(jù)庫信息相一致,預測編碼154個氨基酸;IGF-Ⅰ基因Ⅰ類Eb型為新發(fā)現(xiàn)的剪接異構體,預測編碼188個氨基酸。信號肽分析顯示兩剪接異構體均在49~50位氨基酸處存在潛在的信號肽切割位點;系統(tǒng)進化樹分析顯示兩種剪接異構體在進化上均與哺乳動物更為接近,與靈長類、嚙齒類和兩棲類較遠;蛋白理化性質分析顯示,兩剪接異構體在等電點及親疏水性上存在部分差異,但總體上表明疏水性較弱,親水性較強,為親水性氨基酸;亞細胞定位結果表明二者均為分泌型蛋白質,主要存在于分泌途徑;兩剪接異構體均存在兩個跨膜螺旋,但不存在明顯的跨膜區(qū),不是跨膜蛋白,二者含有不同數(shù)量的糖基化位點和磷酸化位點;蛋白質二級結構分析顯示兩剪接異構體均以α-螺旋為主,蛋白質三級結構分析顯示為明顯的彎曲狀螺旋結構。
[Abstract]:Insulin like growth factor IGF- 鈪,

本文編號:1656437

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