本文選題：人類免疫缺陷病毒　切入點：結(jié)核桿菌　出處：《中國醫(yī)學科學院學報》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的分析人類免疫缺陷病毒(HIV)/結(jié)核桿菌(TB)感染者外周血基因的生物學網(wǎng)絡調(diào)控機制及關鍵蛋白,為HIV/TB感染者的早期診斷和臨床治療提供新依據(jù)。方法從基因芯片公共數(shù)據(jù)庫GEO中下載了22例南非HIV感染者和22例HIV/TB感染者的外周血基因芯片數(shù)據(jù),將數(shù)據(jù)導入分析軟件QOE、STRING、PANTHER、GenClip等,分析兩組患者的基因表達譜、蛋白相互作用網(wǎng)絡、分子生物學過程、基因功能等,尋找區(qū)別兩類患者的關鍵節(jié)點基因。結(jié)果兩組患者15 529個基因的表達譜相似,44名受試者的基因表達譜具有高度關聯(lián)性;251個(1.62%)差異表達基因?qū)υ\斷HIV/TB感染具有良好的診斷能力;RPLP1是蛋白-蛋白相互作用圖譜子網(wǎng)絡的核心節(jié)點;差異表達基因與正向調(diào)節(jié)外界刺激、細胞內(nèi)信號通路的轉(zhuǎn)導、中性粒細胞的遷移、人體免疫等有關,主要參與自由基相關凋亡、炎性反應等通路的活化。結(jié)論共發(fā)現(xiàn)251個差異表達的基因可將單純HIV感染和HIV/TB感染進行區(qū)別,其中差異表達的前40個基因的蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡中所包含的RPLP1基因可能與HIV/TB感染密切關聯(lián),主要涉及正向調(diào)節(jié)外界刺激、細胞內(nèi)信號通路的轉(zhuǎn)導、中性粒細胞的遷移、人體免疫等生物學功能,為HIV/TB感染的診斷和治療提供了一定的參考依據(jù)。
[Abstract]:Objective to analyze the biological network regulation mechanism and key protein of peripheral blood gene in human immunodeficiency virus (HIV) infected patients with HIV / Mycobacterium tuberculosis (TB) infection. Methods the peripheral blood gene chip data of 22 South African HIV infected patients and 22 HIV/TB infected persons were downloaded from GEO, a common database of gene chips, and the data were imported into the software QOERINGPANTHERN GenClip. Analysis of gene expression profiles, protein interaction networks, molecular biological processes, gene functions, etc. Results the expression profiles of 15 529 genes in the two groups were similar to those of 44 subjects. The gene expression profiles of 44 subjects had a high correlation.) the differentially expressed genes had a good value in the diagnosis of HIV/TB infection. RPLP1 is the core node of protein-protein interaction map network. Differentially expressed genes are related to positive regulation of external stimuli, transduction of intracellular signaling pathways, neutrophil migration, human immunity and so on, and are mainly involved in free radical related apoptosis. Conclusion 251 differentially expressed genes can distinguish between HIV infection and HIV/TB infection. The RPLP1 gene contained in the protein-protein interaction network of the first 40 differentially expressed genes may be closely related to HIV/TB infection, mainly involved in positive regulation of external stimulation, transduction of intracellular signal pathway, and neutrophil migration. Human immunity and other biological functions provide a certain reference for the diagnosis and treatment of HIV/TB infection.
【作者單位】： 陜西中醫(yī)藥大學公共衛(wèi)生學院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學教研室;陜西中醫(yī)藥大學第一臨床醫(yī)學院骨科;
【基金】：咸陽市科技局重點項目(2013K12-01) 陜西中醫(yī)藥大學青年基金項目(2015QN05)~~
【分類號】：R512.91

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本文編號：1625139