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萬(wàn)壽菊類(lèi)胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因CCD1克隆與表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-02-23 20:13

  本文關(guān)鍵詞: 萬(wàn)壽菊 類(lèi)胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因 花色 基因表達(dá) 出處:《中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年10期  論文類(lèi)型:期刊論文


【摘要】:【目的】克隆萬(wàn)壽菊(Tagetes erecta L.‘Scarletade’)類(lèi)胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因CCD1(TeCCD1),分析其序列特征和表達(dá)特性,為闡明其在類(lèi)胡蘿卜素降解途徑中生物學(xué)功能及進(jìn)一步探討萬(wàn)壽菊花色形成機(jī)理提供理論基礎(chǔ)!痉椒ā恳罁(jù)萬(wàn)壽菊花蕾轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用同源序列比對(duì)結(jié)果設(shè)計(jì)引物,結(jié)合RT-PCR技術(shù)克隆獲得萬(wàn)壽菊CCD1 cDNA全長(zhǎng),分析其序列特征;利用Real-time PCR分析舌狀花未開(kāi)花蕾、半開(kāi)花蕾、開(kāi)放的頭狀花序和完全開(kāi)放的頭狀花序4個(gè)不同發(fā)育時(shí)期的基因表達(dá)特性!窘Y(jié)果】克隆獲得萬(wàn)壽菊CCD1(Gen Bank登錄號(hào):KX557488)的cDNA全長(zhǎng)序列為1 746 bp,編碼區(qū)長(zhǎng)度1 626 bp,編碼541個(gè)氨基酸。蛋白質(zhì)分析表明TeCCD1為不穩(wěn)定蛋白,不含信號(hào)肽,屬RPE65超家族(登錄號(hào):PF03055),包含CCD家族保守結(jié)構(gòu)域,主要定位于細(xì)胞質(zhì)。萬(wàn)壽菊CCD1核酸序列與除蟲(chóng)菊CCD1同源性最高,為89%;氨基酸序列分析表明萬(wàn)壽菊CCD1與除蟲(chóng)菊CCD1同源性高達(dá)93%,與其他19個(gè)不同種屬的CCD1同源性在75%—83%,說(shuō)明TeCCD1是高度保守的基因;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析顯示TeCCD1的進(jìn)化基本符合植物分類(lèi)學(xué)的進(jìn)化規(guī)律,并具有明顯的種屬特征,萬(wàn)壽菊與菊科同源基因親緣關(guān)系最近。Real-time PCR分析表明TeCCD1在舌狀花發(fā)育過(guò)程中均有表達(dá),隨舌狀花的開(kāi)放逐漸升高,S4期達(dá)到最大值!窘Y(jié)論】克隆獲得萬(wàn)壽菊舌狀花的CCD1,是典型的CCD家族成員,為高度保守的基因,主要定位于細(xì)胞質(zhì),萬(wàn)壽菊舌狀花顏色變淺可能與CCD1表達(dá)量增加導(dǎo)致類(lèi)胡蘿卜素降解有關(guān)。
[Abstract]:In this paper , the cDNA full - length cDNA sequence of Tagetes erecta L . ' Scarletade ' ) was cloned and its sequence identity and expression were analyzed . Conclusion The CCD 1 , a typical CCD family member , is a typical CCD family member . It is a highly conserved gene . It is mainly localized in the cytoplasm , and the color of the tongue - like flower of Tagetes erecta may be related to the increase of the expression level of the CCD 1 , which results in the degradation of carotenoid .

【作者單位】: 上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院;農(nóng)業(yè)部都市農(nóng)業(yè)(南方)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;華中農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝林學(xué)學(xué)院/園藝植物生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:教育部“創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃”(IRT13065)
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2;S681.9

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本文編號(hào):1527454

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