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三種非結(jié)核分枝桿菌esxB基因的克隆與序列分析

發(fā)布時間:2018-02-20 17:38

  本文關(guān)鍵詞: 新金分枝桿菌 母牛分枝桿菌 恥垢分枝桿菌 esxB 表位 出處:《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年05期  論文類型:期刊論文


【摘要】:為了探討非結(jié)核分枝桿菌中EsxB蛋白的生物學(xué)功能,試驗以實驗室分離的母牛分枝桿菌、新金分枝桿菌和恥垢分枝桿菌為對象,克隆了esxB基因,應(yīng)用生物信息學(xué)方法進行系統(tǒng)發(fā)生分析,對EsxB蛋白進行生物學(xué)特性、保守區(qū)分析以及抗原表位、可能的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測。結(jié)果表明:克隆的3種非結(jié)核分枝桿菌的esxB基因大小分別為309 bp、303 bp、294 bp,推導(dǎo)的氨基酸序列與Gen Bank中登錄的相應(yīng)菌種的氨基酸序列同源性分別為95%或97%、100%、100%;屬于WXG100蛋白超家族中CFP-10亞家族成員,具有該亞家族保守的α-螺旋和Yxxx D/E序列;預(yù)測到3條肽鏈線性B細胞表位各1個,T細胞表位各4個、9個、5個,部分T細胞表位與結(jié)核桿菌CFP10的CD8+T細胞表位有5~6個共同氨基酸。
[Abstract]:In order to investigate the biological function of EsxB protein in non - mycobacterium tuberculosis , the esxB gene was cloned , and the esxB gene was cloned . The sequence identity of esxB gene was 309 bp , 303 bp and 294 bp . The deduced amino acid sequence identity was 95 % or 97 % , 100 % and 100 % , respectively .

【作者單位】: 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31272566) 吉林省科技發(fā)展計劃項目(20140204069NY)
【分類號】:S852.61

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