響應(yīng)面法優(yōu)化芘降解菌的降解條件及降解基因分析
本文關(guān)鍵詞: 芘降解菌 鄰苯二酚- -雙加氧酶 響應(yīng)面法 優(yōu)化 出處:《新疆大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2017年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:采用響應(yīng)面法進行實驗設(shè)計,選擇p H值、溫度、天數(shù)為影響因素,對芘濃度為50 mg/L無機鹽培養(yǎng)基進行wp3-1菌株降解條件優(yōu)化,得到了芘降解率與3種因素間的非線性回歸方程,確定了降解芘的最優(yōu)工藝條件:在溫度為34.15?C,p H值為6.98,降解時間為4.28天時,預(yù)測芘的降解率為86.42%,實驗驗證值為85.70%,結(jié)果顯示,建立的模型具有較高的精度.采用PCR技術(shù)克隆鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶基因,生物信息學(xué)分析結(jié)果表明:C23O基因所編碼的氨基酸序列具有雙加氧酶基因保守結(jié)構(gòu)域,編碼的蛋白質(zhì)也是一種穩(wěn)定的酸性親水蛋白質(zhì),分子量為35.01k D,等電點為5.45,二級結(jié)構(gòu)由17%α-螺旋、36%β-折疊和45%的無規(guī)則卷曲組成,具有跨膜結(jié)構(gòu),不具有信號肽.三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果與二級結(jié)構(gòu)一致,三級結(jié)構(gòu)有Fe2+結(jié)合位點.
[Abstract]:Response surface method was used to design the experiment. The pH value, temperature and days were selected as the influencing factors. The degradation conditions of wp3-1 strain were optimized for 50 mg/L inorganic salt medium with pyrene concentration. The nonlinear regression equation between the degradation rate of pyrene and the three factors was obtained. The optimum technological conditions of pyrene degradation were determined as follows: at the temperature of 34.15? When CP H value was 6.98 and degradation time was 4.28 days, the predicted degradation rate of pyrene was 86.42and the experimental verification value was 85.70. The results showed that the established model had high accuracy. The catechol -2o 3-dioxygenase gene was cloned by PCR technique. The results of bioinformatics analysis showed that the amino acid sequence encoded by the 1: C23O gene had a conserved domain of the double oxygenase gene, and the encoded protein was also a stable acidic hydrophilic protein. The molecular weight is 35.01kD, the isoelectric point is 5.45.The secondary structure is composed of 17% 偽 -helix 36% 尾 -fold and 45% irregular crimp. It has a transmembrane structure and no signal peptide. The predicted results of the tertiary structure are consistent with the secondary structure, and the tertiary structure has Fe2 binding site.
【作者單位】: 新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31460027)
【分類號】:X172
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本文編號:1512601
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