6個染色體區(qū)域的基因多態(tài)性與冠心病易感性的關聯(lián)性研究
發(fā)布時間:2018-02-08 14:43
本文關鍵詞: CAD SNPs 基因型 等位基因 冠脈造影術 出處:《重慶醫(yī)科大學》2017年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:背景:冠心病(Coronary artery disease,CAD)是一種由冠狀動脈器質性狹窄或阻塞引起的心肌缺血缺氧或心肌壞死的心臟病,又稱缺血性心臟病。作為一種嚴重危害全球健康的常見慢性疾病,CAD的致病率和致死率極高。在中國,CAD是造成人們死亡的首要原因。CAD的發(fā)病機制現(xiàn)在還不完全清楚。目前可以確定的是CAD是一種復雜的多基因遺傳病,其發(fā)病原因包括環(huán)境因素、遺傳因素以及二者之間的相互作用。近年來,世界范圍內(nèi)對心血管疾病尤其是CAD等復雜性疾病的全基因組關聯(lián)研究(Genome-wide association study,GWAS)迅速發(fā)展,發(fā)現(xiàn)了CAD的一系列相關基因或位點,將人類基因組研究推向了一個新的階段。本文根據(jù)近年來國內(nèi)外與CAD相關的GWAS研究結果,選擇了位于1號、6號、10號、12號、17號和19號共6個染色體區(qū)域的rs413582、rs693758、rs9349379、rs1004467、rs17115149、rs12413409、rs3519、rs1169310、rs9899364和rs428253等10個位點,通過病例對照研究,探討位于以上染色體區(qū)域的位點與CAD易感性和嚴重程度的關聯(lián)。第一部分6個染色體區(qū)域的基因多態(tài)性與冠心病易感性的關聯(lián)性研究目的:通過研究GWAS曾經(jīng)報道過的6個染色體區(qū)域中的rs413582、rs693758、rs9349379、rs1004467、rs17115149、rs12413409、rs3519、rs1169310、rs9899364和rs428253位點基因型及其等位基因在重慶地區(qū)漢族人群中CAD患者和對照人群的頻率分布情況,探索這些染色體區(qū)域SNPs與CAD發(fā)病的易感性關系,從而為CAD高危人群的早期篩檢和預防治療提供新的靶點和依據(jù)。方法:(1)采用病例-對照研究的方法,在重慶地區(qū)選擇符合CAD診斷標準的928例患者作為CAD組,選擇同一時期內(nèi)的928例非CAD人群作為Control組;(2)采用Tiangen DP318 DNA離心柱型試劑盒進行外周血細胞基因組DNA的提取,并用Sequenom Mass Array系統(tǒng)對rs413582、rs693758、rs9349379、rs1004467、rs17115149、rs12413409、rs3519、rs1169310、rs9899364和rs428253位點進行SNPs分型檢測;(3)研究人群的基本情況、SNPs的基因型和等位基因在各組的頻率分布與CAD的關聯(lián)性分析均采用SPSS20.0進行。結果:(1)與TT基因型相比,rs413582的CC基因型可減少CAD、早發(fā)CAD和女性CAD的發(fā)病風險(CAD:OR=0.696,95%CI:0.496-0.975;早發(fā)CAD:OR=0.480,95%CI:0.245-0.942;女性CAD:OR=0.624,95%CI:0.395-0.988);rs413582的CT基因型則與降低CAD和男性CAD發(fā)病風險相關(CAD:OR=0.785,95%CI:0.627-0.982;男性CAD:OR=0.682,95%CI:0.493-0.943)。C等位基因與減少CAD、早發(fā)CAD、遲發(fā)CAD和男性CAD發(fā)病風險均存在統(tǒng)計學關聯(lián)(p0.05)(2)與G等位基因相比,rs9349379的A等位基因可降低CAD和女性CAD的發(fā)病風險(CAD:OR=0.853,95%CI:0.738-0.986;女性CAD:OR=0.802,95%CI:0.652-0.986)。(3)rs9899364的AG基因型頻率在CAD組和Control組的分布中有統(tǒng)計學差異(p=0.036);A等位基因對CAD、遲發(fā)CAD和女性CAD的發(fā)病均有保護作用(CAD:OR=0.855,95%CI:0.750-0.975;遲發(fā)CAD:OR=0.830,95%CI:0.707-0.974;女性CAD:OR=0.828,95%CI:0.689-0.995)(4)遺傳模型分析結果顯示:在顯性模型中,rs413582(p=0.014)和rs9899364(p=0.038)的野生型純合子均為CAD的危險因素。結論:(1)rs413582與CAD易感性有顯著性關聯(lián);(2)rs9349379的A等位基因可降低CAD和女性人群CAD的發(fā)生風險;(3)rs9899364的AG基因型和CAD易感性有關,A等位基因可降低CAD、遲發(fā)CAD和女性人群CAD的發(fā)病風險。第二部分6個染色體區(qū)域的基因多態(tài)性與冠心病嚴重程度的關聯(lián)性研究目的:在診斷為CAD的患者中選取接受了冠脈造影術(Coronary angiography,CAG)的患者共400例進行SNPs多態(tài)性與CAD嚴重程度的分析,以探討基因多態(tài)性對CAD嚴重程度的影響。方法:(1)在重慶市的六所醫(yī)院中選擇確診為CAD且接受過CAG治療或檢查的患者400例作為病例組,選擇同一時期在這6所醫(yī)院進行健康體檢的參與人員作為對照組。(2)所有患者的CAG造影結果均由兩位以上經(jīng)驗豐富的心內(nèi)科醫(yī)生進行判定,并采用Gensini積分評分系統(tǒng)對判定結果進行Gensini評分。結果:(1)與TT基因型相比,rs413582的CT基因型可降低右冠(Right coronary artery,RCA)病變和左前降支(Left anterior descending artery,LAD)病變的風險(RCA:OR=0.559,95%CI:0.362-0.861;LAD:OR=0.578,95%CI:0.409-0.819);rs9349379的AG基因型攜帶者發(fā)生LAD病變的風險為GG基因型攜帶者的0.63倍(OR=0.630,95%CI:0.446-0.889);rs9899364的AG基因型則與降低RCA病變、LAD病變和左回旋支(Left circumflex,LCX)病變有統(tǒng)計學關聯(lián)(RCA:OR=0.550,95%CI:0.359-0.842;LAD:OR=0.586,95%CI:0.409-0.839;LCX:OR=0.531,95%CI:0.327-0.863),且攜帶rs9899364的AA基因型者RCA病變風險比攜帶GG基因型者低(OR=0.350,95%CI:0.185-0.665)。(2)rs413582、rs9349379和rs9899364的基因型頻率在2支血管病變(Vessel disease,VD)組與Control組中的分布差異均有統(tǒng)計學意義(p值分別為0.041,0.022和0.036),rs9899364的基因型還與1VD相關(p=0.023)。(3)rs9349379的G等位基因頻率和Gensini評分等級呈正相關關系,隨著其頻率增加,相應的Gensini評分等級也升高(ptrend=0.026)。結論:(1)rs413582、rs9349379和rs9899364的雜合子基因型均與中國漢族人群的CAD病變部位相關;(2)rs413582、rs9349379和rs9899364的基因多態(tài)性均與引CAD的2支血管病變有關聯(lián);(3)rs9349379的等位基因劑量可影響CAD的嚴重程度。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:重慶醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R541.4
【參考文獻】
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,本文編號:1495685
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