本文關(guān)鍵詞： 燒傷 免疫系統(tǒng)過程 差異表達(dá)基因 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)　出處：《南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的利用生物信息學(xué)方法對小鼠燒傷早期免疫細(xì)胞差異基因表達(dá)譜進(jìn)行分析并檢測,篩選相關(guān)差異基因,以期找到潛在的診斷及治療靶標(biāo)。方法從GEO數(shù)據(jù)庫中下載GSE7404數(shù)據(jù)集,通過配對樣本t檢驗(yàn)、倍比法及GO功能富集分析篩選差異表達(dá)基因,應(yīng)用STRING數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選相關(guān)基因靶標(biāo),運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR及Western blotting進(jìn)行試驗(yàn)驗(yàn)證。結(jié)果在燒傷后第1天,有1825個(gè)基因被選出,其中上調(diào)基因658個(gè),下調(diào)基因1167個(gè)。運(yùn)用STRING數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析,發(fā)現(xiàn)Stat1、Cdk1、Cd19、Lck及Jun基因在燒傷后免疫系統(tǒng)功能變化過程中可能起到重要作用。實(shí)時(shí)熒光定量PCR及Western blotting檢測顯示Stat1、Cdk1和Jun基因表達(dá)情況與分析結(jié)果相一致。結(jié)論通過對小鼠燒傷后早期全血游離白細(xì)胞基因芯片分析我們發(fā)現(xiàn)Stat1、Cdk1和Jun基因在燒傷早期免疫細(xì)胞功能變化的過程中發(fā)揮重要的作用,可能是燒傷早期診斷及治療的潛在的生物學(xué)靶標(biāo)。
[Abstract]:Objective to analyze and detect the differential gene expression profiles of mouse immune cells in the early stage of burn by bioinformatics, and to screen the related differentially expressed genes. Methods GSE7404 data sets were downloaded from GEO database, and differentially expressed genes were screened by paired t-test, doubling analysis and go function enrichment analysis. STRING database and Cytoscape software were used to construct protein interaction network to screen related gene targets. Real-time fluorescence quantitative PCR and Western blotting were used to verify the results. Results on the first day after burn, 1825 genes were selected, of which 658 genes were up-regulated. STRING database and Cytoscape software were used to construct protein interaction network analysis. Lck and Jun genes may play an important role in the changes of immune system function after burn. Real-time fluorescence quantitative PCR and Western blotting detection show Stat1. The expression of Cdk1 and Jun genes was consistent with the results of the analysis. Conclusion Stat1 was found by gene microarray analysis of the whole blood free leukocytes in the early stage of burn in mice. Cdk1 and Jun genes play an important role in the changes of immune cell function in the early stage of burn and may be potential biological targets for early diagnosis and treatment of burn.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院燒傷科;
【基金】：廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014A020212189) 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院院長基金(2014B013) 廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(201607010242)
【分類號(hào)】：R644
【正文快照】： 嚴(yán)重?zé)齻颊邆笕菀装l(fā)生多種難以控制的并發(fā)癥,尤其是全身炎癥反應(yīng)綜合征(SIRS)和多器官功能衰竭(MODS)甚至是死亡[1-2]。而導(dǎo)致諸多并發(fā)癥發(fā)生的各種原因中,免疫功能紊亂是其中的重要因素之一[2-3]。目前對于燒傷免疫方面的研究多是對免疫細(xì)胞、免疫因子的作用機(jī)制或感染、

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前9條

1 金輝;高艷彬;盧志陽;鄒瓊;史鵬偉;楊磊;;差異基因表達(dá)譜分析小鼠燒傷早期免疫細(xì)胞刺激反應(yīng)的相關(guān)基因靶標(biāo)[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2015年12期

2 高艷彬;盧志陽;金輝;史鵬偉;王桂芳;溫皇鼎;楊磊;;小鼠燒傷后時(shí)序芯片數(shù)據(jù)分析及免疫標(biāo)志物的初步篩選[J];暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版);2015年03期

3 張明君;舒申友;周鏡桂;毛小炎;;探究增生性瘢痕成纖維細(xì)胞中CDK4、CDK2、CDK1基因與細(xì)胞周期的相關(guān)性[J];中國醫(yī)學(xué)創(chuàng)新;2015年09期

4 林綺文;吳長有;;IFN-α磷酸化STAT1和STAT4誘導(dǎo)人NK細(xì)胞產(chǎn)生IFN-γ并增強(qiáng)其殺傷活性[J];免疫學(xué)雜志;2011年09期

5 陳建勇;王聰;王娟;曹禮榮;;MAPK信號(hào)通路研究進(jìn)展[J];中國醫(yī)藥科學(xué);2011年08期

6 彭代智;;我國燒傷免疫的研究[J];中華燒傷雜志;2008年05期

7 胡振富,羅力生;病理性瘢痕中原癌基因c-myc和c-fos的表達(dá)[J];實(shí)用美容整形外科雜志;2001年04期

8 劉毅,薛曉東,賈赤宇,陳璧;恒溫恒壓電燙儀建立小鼠燙傷模型的實(shí)驗(yàn)研究[J];蘭州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2001年01期

9 馮雪,段銀鐘,林珠,王凌;大鼠實(shí)驗(yàn)性牙齒移動(dòng)誘導(dǎo)中樞立即早期基因c-fos和c-jun的表達(dá)與調(diào)節(jié)[J];中華口腔醫(yī)學(xué)雜志;2000年04期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 楊李強(qiáng);孫愛華;徐旖旎;張彥燕;潘迪;陳妍;陶玲;沈祥春;;氧化苦參堿通過調(diào)控MAPK信息通路改善醛固酮誘導(dǎo)的心肌細(xì)胞損傷[J];中國實(shí)驗(yàn)方劑學(xué)雜志;2017年15期

2 王子賀;鄧曉東;張陽;費(fèi)小雯;;萊茵衣藻MAPK4基因RNAi載體的構(gòu)建及鑒定[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年19期

3 鄒瓊;高艷彬;金輝;盧志陽;史鵬偉;楊磊;;小鼠燒傷早期免疫細(xì)胞基因表達(dá)譜分析及靶基因的篩選[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2017年06期

4 黃夢玲;王雄;吳金虎;;中藥治療燒燙傷的作用機(jī)制研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2017年11期

5 鄧惠堅(jiān);張衛(wèi);盧群市;;藁本內(nèi)酯對動(dòng)脈粥樣硬化患者血管平滑肌細(xì)胞遷移的影響及其作用機(jī)制的研究進(jìn)展[J];實(shí)用心腦肺血管病雜志;2017年04期

6 張鴻程;陳彪;謝慶平;談偉健;趙紹云;;鞘內(nèi)注射ERK1/2抑制劑對骨癌痛大鼠的鎮(zhèn)痛作用研究[J];醫(yī)學(xué)研究雜志;2017年05期

7 艾尼·沙塔爾;吐爾遜太·木哈買提;蘇毅;張衛(wèi)群;李炳軍;;三陰性乳腺癌中MAPK及SNAIL蛋白的表達(dá)及臨床意義[J];腫瘤學(xué)雜志;2017年05期

8 徐劍華;李鵬;;Ras-MAPK信號(hào)通路對蛋雞卵泡顆粒細(xì)胞STMN2蛋白表達(dá)的影響[J];黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào);2017年02期

9 陳尚雅;崔冠群;賈強(qiáng);薄存香;杜忠君;邵華;;染矽塵大鼠差異性表達(dá)基因生物信息學(xué)分析[J];中國職業(yè)醫(yī)學(xué);2017年02期

10 姜珊;韓巖;;細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶5對內(nèi)皮細(xì)胞血管形成能力影響的研究進(jìn)展[J];中國美容整形外科雜志;2017年04期

【二級參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 高艷彬;盧志陽;金輝;史鵬偉;王桂芳;溫皇鼎;楊磊;;小鼠燒傷后時(shí)序芯片數(shù)據(jù)分析及免疫標(biāo)志物的初步篩選[J];暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版);2015年03期

2 金文虎;王達(dá)利;聶開瑜;唐紅梅;魏在榮;;增生性瘢痕成纖維細(xì)胞中CyclinD1,CDK2,CDK4作用及與細(xì)胞周期的相關(guān)性[J];中國組織工程研究;2012年24期

3 常曉彤;輦曉峰;王振輝;;Toll樣受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑研究進(jìn)展[J];生理科學(xué)進(jìn)展;2011年05期

4 陳仁瓊;周之海;;P16和CDK4在乳房外Paget病中的表達(dá)及相關(guān)性分析[J];天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2010年02期

5 范艷瑩;吳長有;;CFSE標(biāo)記結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)在研究NK細(xì)胞分裂與殺傷功能中的應(yīng)用[J];免疫學(xué)雜志;2010年01期

6 楊松林;萬偉東;鄭江紅;張世新;高云;鄧辰亮;;轉(zhuǎn)染Sp1基因?qū)θ嗽錾择：鄢衫w維細(xì)胞膠原表達(dá)的影響[J];中華整形外科雜志;2009年01期

7 彭代智;;我國燒傷免疫的研究[J];中華燒傷雜志;2008年05期

8 李世榮;;病理性瘢痕研究的幾個(gè)重要問題[J];中華整形外科雜志;2008年05期

9 范艷瑩;吳長有;;人NK細(xì)胞亞群與生物學(xué)功能關(guān)系的研究進(jìn)展[J];中國免疫學(xué)雜志;2008年02期

10 舒?zhèn)?馬清鈞;葉昕;;CyclinE-CDK2相關(guān)蛋白與細(xì)胞周期調(diào)控[J];生物技術(shù)通訊;2008年01期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王先福;;NDRG-1基因的研究進(jìn)展[J];河南醫(yī)學(xué)研究;2010年01期

2 董琳;胡潔;王全凱;李軍延;王健;謝廣云;孫金秀;許建寧;;甲基丙烯酸環(huán)氧丙酯致人支氣管上皮細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化過程中相關(guān)基因表達(dá)變化的研究[J];癌變·畸變·突變;2010年04期

3 馬兵,吳軍,易紹萱,羅高興,賀偉峰,王珍祥,陳烯偉;表達(dá)譜基因芯片篩選燒傷后增生性瘢痕相關(guān)基因的研究[J];中華創(chuàng)傷雜志;2001年06期

4 馬敬全;耿曉星;;分化相關(guān)基因NDRG1在惡性腫瘤中的研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué);2009年12期

5 王金津;錢夕元;李雪;楊輝華;梁瓊麟;王義明;羅國安;;雙龍方有效成分誘導(dǎo)干細(xì)胞分化過程中差異表達(dá)基因的篩選和聚類分析[J];世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化;2007年03期

6 劉梅,王林芳,丁斐,王東,顧曉松;中藥神經(jīng)再生素作用于背根神經(jīng)節(jié)細(xì)胞過程中基因的表達(dá)變化[J];解剖學(xué)報(bào);2003年03期

7 張玉芳;陳穎;陳雪;李奕;林巍巍;王曉冬;陸璐;;Soat1基因的e-QTL定位和遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析[J];江蘇醫(yī)藥;2014年02期

8 華琳;鄭衛(wèi)英;閆巖;;傳遞不平衡在人類基因表達(dá)變化中的應(yīng)用[J];中國優(yōu)生與遺傳雜志;2007年05期

9 崔小緩;張延平;張曉強(qiáng);李麗娜;蔣興旺;;GJB2基因條件敲除小鼠耳蝸凋亡相關(guān)基因表達(dá)差異研究[J];聽力學(xué)及言語疾病雜志;2014年02期

10 馬海涵,廖維宏,伍亞民,初同偉;新生大鼠脊髓損傷修復(fù)差異表達(dá)基因的篩選[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2004年01期

相關(guān)會(huì)議論文 前8條

1 李勇;趙如冰;陳星;;同型半胱氨酸誘發(fā)體外培養(yǎng)大鼠胚胎基因表達(dá)變化的基因芯片研究[A];中國毒理學(xué)會(huì)第三屆全國學(xué)術(shù)會(huì)議論文（摘要）集[C];2001年

2 張家平;黃躍生;楊宗城;;燒傷早期心肌組織幾種炎癥相關(guān)基因表達(dá)變化的實(shí)驗(yàn)研究[A];全國燒傷創(chuàng)面處理、感染專題研討會(huì)論文匯編[C];2004年

3 伍亞民;劉媛;王正國;;Hes基因在神經(jīng)干細(xì)胞發(fā)育中的作用[A];“基因、進(jìn)化與生理功能多樣性”海內(nèi)外學(xué)術(shù)研討會(huì)暨中國生理學(xué)會(huì)第七屆比較生理學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要[C];2009年

4 馬慧敏;呂曉迎;陸慧琴;;基于GenMAPP的Ni~(2+)表達(dá)譜芯片實(shí)驗(yàn)差異表達(dá)基因的功能路徑分析[A];中國生物醫(yī)學(xué)工程進(jìn)展——2007中國生物醫(yī)學(xué)工程聯(lián)合學(xué)術(shù)年會(huì)論文集（下冊）[C];2007年

5 張繼紅;梁力建;黃潔夫;;Fas基因表達(dá)變化在Genistein抑制肝癌增長中的作用[A];第十二屆全國肝癌學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2009年

6 李玲;鄔利婭-伊明;趙蕾;于永生;李冬潔;蘇定馮;;RAS各組份的基因在SHR心、腎、主動(dòng)脈中的表達(dá)及其意義[A];第九屆全國心血管藥理學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2007年

7 朱瑩瑩;倪道鳳;許彩民;;AD模型大鼠嗅球組織基因表達(dá)變化的篩選及目的基因的驗(yàn)證[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十次全國耳鼻咽喉-頭頸外科學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編（下）[C];2007年

8 黃文芳;楊永長;劉華;曾婭莉;周定安;胥國強(qiáng);劉文;;基因芯片技術(shù)篩選辛伐他汀作用K562細(xì)胞的差異表達(dá)基因[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議資料匯編[C];2008年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前3條

1 衣曉峰;哈醫(yī)大一院系列研究阿爾茨海默病關(guān)聯(lián)基因[N];中國醫(yī)藥報(bào);2007年

2 楊駿;肥胖可能與炎癥基因有關(guān)[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2004年

3 通訊員 蔡心軼 記者 程守勤;哪些人體基因易受PM2.5影響[N];健康報(bào);2014年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 陳紅艷;刺槐中參與共生固氮的結(jié)瘤相關(guān)基因的分離鑒定和功能分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

2 董燕妮;擬南芥和油菜磷脂酶基因pPLAIIIδ的功能分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

3 任艷萍;轉(zhuǎn)PRL基因小鼠模型的構(gòu)建與Stat5a的乳腺發(fā)育調(diào)控機(jī)理研究[D];廣西大學(xué);2014年

4 施堯;枯草桿菌蛋白酶基因6在須癬毛癬菌致病性中的功能研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

5 吳幼容;觀音竹鹽脅迫的生理響應(yīng)與基因表達(dá)分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2012年

6 張靜思;基于基因芯片和生物學(xué)分析技術(shù)對血管緊張素Ⅱ誘導(dǎo)的高血壓急性腎臟損傷相關(guān)基因的研究[D];大連醫(yī)科大學(xué);2015年

7 訾臣;miRNAs對斷奶仔豬大腸桿菌抗性的調(diào)控作用及機(jī)制分析[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年

8 谷溪;miR-124a促進(jìn)神經(jīng)突起生長靶基因及其作用機(jī)制的研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2013年

9 張亮;擬南芥Athspr新基因的抗鹽性及表達(dá)調(diào)控研究[D];蘭州大學(xué);2014年

10 王海飛;豬外周血單核細(xì)胞抗病毒反應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組及全基因組DNA甲基化調(diào)控研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 李紫薇;蒺藜苜蓿E2F/DP基因鑒定及鹽脅迫表達(dá)分析[D];東北林業(yè)大學(xué);2015年

2 栗振義;紫花苜蓿熱激蛋白基因MsHSP70的克隆及功能分析[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

3 陳凱麗;綿羊SPLUNC1基因的克隆、表達(dá)及活性檢測[D];石河子大學(xué);2015年

4 翟曼君;雞與鵪鶉屬間雜交種胚胎早期死亡相關(guān)基因的功能研究[D];石河子大學(xué);2015年

5 任曉宇;飛蝗CYP4和CYP303A1基因的分子特性和功能研究[D];山西大學(xué);2014年

6 劉恒生;豬LMNA基因?qū)τ诩∪夂椭景l(fā)育及分化的調(diào)控研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

7 謝向;小麥組蛋白去乙�；富騎aHD2C功能研究[D];山東大學(xué);2015年

8 劉明麗;斑馬魚低溫響應(yīng)基因順式調(diào)控元件的鑒定及鱗頭犬牙南極魚ATP6V0C基因在HeLa細(xì)胞中抗寒研究[D];上海海洋大學(xué);2015年

9 張偉;轉(zhuǎn)錄組篩選調(diào)控脂肪儲(chǔ)存基因[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2015年

10 孔曄;馬鈴薯甲蟲4個(gè)細(xì)胞色素P450氧化酶基因的分子克隆及功能驗(yàn)證[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

，

本文編號(hào)：1465070