本文關(guān)鍵詞： 大黃屬CHS基因 密碼子偏愛性 GC GC ENC 最優(yōu)密碼子　出處：《分子植物育種》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為探究蓼科大黃屬物種CHS基因密碼子的偏愛性,鑒定出該類基因的最優(yōu)密碼子。利用EMBOSS、Codon W1.4.4和SPSS 17.0軟件對24條來源于大黃屬不同物種的CHS基因進行多元統(tǒng)計分析,以深入研究其偏愛性。結(jié)果表明,大黃屬CHS基因密碼子的GC_3含量最高,其與GC_(12)的相關(guān)性檢驗未達到顯著水平。ENC-plot分析顯示,24條CHS基因的ENC值均低于預(yù)期值。以上證明了自然選擇是CHS基因密碼子偏愛性形成的主導(dǎo)因素。篩選出的26個最優(yōu)密碼子中,17個密碼子的第3位堿基為G/C,表明CHS基因最優(yōu)密碼子偏愛以G/C結(jié)尾。
[Abstract]:In order to investigate the codon preference of CHS gene in Rheum species of Polygonaceae, the optimal codon of this kind of gene was identified. EMBOSS was used. Codon W1.4.4 and SPSS 17.0 software were used to analyze 24 CHS genes from different species of Rhubarb in order to study their preference. The GC_3 content of CHS gene codon was the highest in Rhubarb, and the correlation test between GC_3 and GCS-12) did not reach the significant level. ENC-plot analysis showed that the codon content of rhubarb gene was the highest. The ENC values of 24 CHS genes were all lower than the expected values, which proved that natural selection was the leading factor in the formation of codon preference of CHS gene. The third base of 17 codon is G / C, which indicates that the optimal codon of CHS gene ends with G / C.
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院學(xué)科建設(shè)雙支項目,四川農(nóng)業(yè)大學(xué)雙支計劃共同資助
【分類號】：Q943.2
【正文快照】： The Codon Usage Analysis in CHS Gene within the Polygonaceae RheumMa Shengchao Yu Xinmei Yao Huipeng*College of Life Science,Sichuan Agricultural University,Ya'an,625014*Corresponding author,yaohuipeng0921@163.comYuzhong(Molecular Plant Breeding),15(6):2

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本文編號：1465031