六種常見牧草Matk基因DNA條形碼研究
本文關鍵詞: Matk基因 牧草 DNA條形碼 鑒別 出處:《中獸醫(yī)醫(yī)藥雜志》2016年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:采用DNA條碼(DNA Barcoding)技術對紫草科(聚合草)、豆科(紫花苜蓿、箭{H豌豆)和禾本科(羊茅、芨芨草和針茅)等6種牧草Matk基因的3個核苷酸片段(Matk1、Matk2、Matk3)進行測定和分析。結果表明,由于堿基插入(缺失),Matk1和Matk2各存在3種長度類型(L1~(259)、L1~(260)、L1~(262)及L2~(245)、L2~(246)、L2~(247)),Matk3存在2種長度類型(L3~(149)和L3~(150));因堿基變異,Matk1、Matk2和Matk3分別有4個(H1~A、H1~B、H1~C和H1~D)、3個(H2~A、H2~B和H2~C)和2個(H3~A和H3~B)單倍類型。據(jù)此建立了由堿基變異和插入(缺失)片段組合而成的6種牧草Matk基因識別碼。根據(jù)堿基變異和插入(缺失)位點顏色差異及其所占據(jù)的相對位置,制作了DNA彩色條形碼,通過比較縱向位置上的顏色差異實現(xiàn)6種牧草的鑒別。
[Abstract]:The DNA barcode Barcodingtechnique was used to study the effects of Artemiaceae (Alfalfa, Arrow {H Pea) and Gramineae (Festuca fescue) on Lymphaceae (Polygonatum), legume (Alfalfa, H pea). The three nucleotide fragments of Matk gene of six forage species, Achnatherum splendens and Stipa splendens, were determined and analyzed. The results showed that the Matk gene was inserted (missing). In Matk1 and Matk2, there were three length types: L1 / 259U / L1 / 260/ L1 / 262and L2 / 245/ L2 / 246respectively). There are two length types, L _ 3 and L _ (3), and L _ (3) ~ (1) and T _ (3) T _ (3), respectively, in L _ 2 ~ (2 +) ~ (247) and Matk3. Because of the base mutation, Matk1, Matk2 and Matk3 had four AH1, H1, BH1, and 3 H2H2A, respectively. The haplotypes of H _ 2o _ B and H _ 2C and H _ 3H _ 3A and H _ 3O _ B) haplotypes have been established based on which the base mutation and insertion (deletion) have been established. The Matk gene identification codes of 6 species of forage grass were composed of fragments. According to the color difference of base mutation and insertion (deletion) site and the relative position they occupied. The DNA color bar code was made and the color difference in longitudinal position was compared to realize the identification of 6 species of forage grass.
【作者單位】: 甘肅農(nóng)業(yè)大學草業(yè)學院草業(yè)生態(tài)系統(tǒng)教育部重點實驗室(甘肅農(nóng)業(yè)大學)中-美草地畜牧業(yè)可持續(xù)發(fā)展研究中心;甘肅農(nóng)業(yè)大學動物科學技術學院;
【基金】:甘肅省高等學?蒲许椖(2013A-064)
【分類號】:S54
【正文快照】: DNA條形碼是通過一段或幾段通用的標準DNA序列對物種進行識別和鑒定的技術[1-3],從分子水平上對物種進行鑒定,為研究群落中物種網(wǎng)絡提供了手段。在動植物間的植食網(wǎng)絡關系中,當觀察動物的行為存在困難時,可利用動物消化道中的食物殘渣,借助DNA條形碼技術分析其采食的植物,研究
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,本文編號:1461671
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