水稻堊白基因Chalk5功能標記的開發(fā)與應用
本文關鍵詞: 水稻 堊白 Chalk 等位基因特異PCR 功能標記Q 出處:《華北農(nóng)學報》2017年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:水稻堊白是衡量水稻外觀品質優(yōu)劣的重要指標之一,降低稻米的堊白是培育優(yōu)質水稻品種的前提。Chalk5是一個能顯著降低稻米堊白從而提高稻米外觀品質的主效基因。為提高堊白基因Chalk5在育種中的選擇效率,在前人克隆的基礎上,根據(jù)其啟動子區(qū)域存在的2個功能突變位點,分別設計等位基因特異PCR(ARMS-PCR)引物,最終篩選出2對Chalk5基因的功能標記Chalk12、NChalk12和Chalk22、NChalk22,通過PCR產(chǎn)物測序的方法對這2對標記的檢查結果進行了驗證,說明Chalk12、NChalk12和Chalk22、NChalk22可以準確鑒定出Chalk5的不同基因型。利用該標記對不同來源的43份秈稻資源、江蘇2007-2013年審定的65份粳稻品種和太湖流域179份粳稻地方資源進行了Chalk5基因型檢測,篩選到攜帶chalk5低堊白率等位基因的秈稻資源20份,太湖流域粳稻地方資源僅8份,其余259份粳型資源中均不攜帶chalk5低堊白率等位基因,這也說明chalk5主要分布在秈型水稻資源中,在粳型資源中分布很少。
[Abstract]:Rice chalkiness is one of the important indexes to evaluate the appearance quality of rice. Chalk5 is a major gene that can significantly reduce chalkiness and improve the appearance quality of rice. In order to improve the chalkability gene Chalk5 in breeding, chalk5 is a major gene that can reduce chalkiness significantly and improve the appearance quality of rice. The selection efficiency in. On the basis of previous cloning, allele-specific primers were designed according to the two functional mutation sites in the promoter region. Finally, two functional markers of Chalk5 gene, Chalk12, NChalk12 and Chalk22, were screened out. The results of the two pairs of markers were verified by PCR sequencing, indicating that Chalk12, NChalk12 and Chalk22. Different genotypes of Chalk5 could be identified by NChalk22, and 43 varieties of indica rice from different sources could be identified by this marker. Chalk5 genotypes of 65 japonica rice varieties and 179 japonica rice local resources from 2007 to 2013 in Jiangsu Province were detected. Twenty indica rice resources with low chalkiness rate allele of chalk5 and only 8 japonica rice native resources in Taihu Basin were screened. None of the remaining 259 japonica resources carried low chalkiness rate alleles of chalk5, which indicated that chalk5 was mainly distributed in indica rice resources and rarely in japonica rice resources.
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學院糧食作物研究所國家水稻改良中心南京分中心;揚州大學江蘇省糧食作物現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術協(xié)同創(chuàng)新中心;蘇州農(nóng)業(yè)職業(yè)技術學院;揚州大學生物科學與技術學院;
【基金】:國家自然科學基金項目(31400175) 江蘇省自然科學基金項目(BK20130725) 江蘇省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研發(fā)項目(BE2015355) 江蘇科技成果轉化資金(BA2014134) 公益性行業(yè)科研專項(201303102) 揚州市農(nóng)業(yè)前瞻性研究項目(YZ2014165)
【分類號】:S511
【正文快照】: 水稻是我國重要的糧食作物,種植面積和總產(chǎn)都位居第一。隨著人們生活水平的提高,消費者對稻米品質需求越來越高。稻米品質主要包括加工品質、外觀品質、蒸煮食味品質和營養(yǎng)品質,具體內(nèi)容有:透明度、堊白、粒型、直鏈淀粉含量、膠稠度、糊化溫度、蛋白質含量以及有無香味等。其
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,本文編號:1461559
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