本文關(guān)鍵詞：大蔥AfCER1基因的克隆及表達分析

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【摘要】：基于大蔥RNA-seq轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中蠟質(zhì)相關(guān)基因Af CER1的序列設(shè)計引物,利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE(Rapid amplification of c DNA ends)技術(shù)獲得Af CER1(Allium fistulisum CER1)的全長c DNA序列,并通過生物信息學(xué)手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析Af CER1基因在大蔥野生型和突變型植株中的空間表達模式。結(jié)果表明,Af CER1基因全長為2 144 bp,包含一個1 857 bp完整的開放閱讀框(ORF),編碼618個氨基酸。蛋白序列比對分析表明,Af CER1與其他物種的CER1具有相似的結(jié)構(gòu)域:脂肪酸羥化酶結(jié)構(gòu)域和WAX2-C結(jié)構(gòu)域。由RT-PCR的結(jié)果可知,Af CER1基因在大蔥的根、葉鞘、葉片等部位均有表達,且在野生型和突變型植株中的表達量有差異。Real-time PCR分析表明,在大蔥的根和葉鞘及剛見光的葉片中,Af CER1在突變型植株中的表達量相對野生型少;而在見光較多的葉片部位,Af CER1在突變型植株中的表達量卻比野生型多。研究可為大蔥蠟質(zhì)合成的分子機制提供理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研究中心農(nóng)業(yè)部華北地區(qū)園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室蔬菜種質(zhì)改良北京市重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31372066) 北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新能力建設(shè)專項(KJCX201101010)
【分類號】：S633.1
【正文快照】： 與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室,蔬菜種質(zhì)改良北京市重點實驗室,北京100097)表皮蠟質(zhì)是大多數(shù)陸地植物角質(zhì)層的重要組成部分,覆蓋于陸地植物的表皮,可以減緩陸地植物對生物和非生物的脅迫,如防止干旱、病蟲害,病原體和紫外輻射對植物的侵害[1-2],是植物的保護屏障。受遺傳多樣性和后天，

本文編號：1272702