本文關(guān)鍵詞：人TRIM28基因及蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：[目的]通過(guò)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)分析人TRIM28基因的啟動(dòng)子及蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、信號(hào)肽、親疏水性、跨膜區(qū)域、蛋白結(jié)構(gòu)、與之相互作用的蛋白質(zhì)及功能。[方法]使用相應(yīng)軟件分析TRIM28相關(guān)信息。[結(jié)果]TRIM28的3個(gè)啟動(dòng)子中第一個(gè)通過(guò)甲基化對(duì)其表達(dá)影響較深;TRIM28蛋白質(zhì)是由835個(gè)氨基酸組成的無(wú)信號(hào)肽、無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定親水蛋白質(zhì),等電點(diǎn)為5.52,哺乳動(dòng)物中高度保守;二級(jí)結(jié)構(gòu)包括10個(gè)α螺旋和12個(gè)β折疊片層,三級(jí)結(jié)構(gòu)構(gòu)建需更多可靠的模板;TRIM28主要定位于細(xì)胞核,自身及相互作用蛋白質(zhì)主要參與染色質(zhì)修飾及DNA損傷修復(fù)過(guò)程。[結(jié)論]TRIM28第一個(gè)啟動(dòng)子甲基化影響其表達(dá),蛋白質(zhì)無(wú)信號(hào)肽、無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)、不穩(wěn)定系數(shù)高達(dá)46.43,屬不穩(wěn)定親水蛋白質(zhì),定位細(xì)胞核,參與染色質(zhì)修飾和DNA損傷修復(fù)。
【作者單位】： 河南中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心;
【分類(lèi)號(hào)】：Q811.4
【正文快照】： TRIM28又稱(chēng)KAP1、TIF1β,是TIF1家族中重要的一員,是一個(gè)重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)抑制因子[1-3]。TRIM28與細(xì)胞的各種行為具有密切聯(lián)系,如細(xì)胞分化、精子發(fā)生[4-5]、T、B細(xì)胞發(fā)育、DNA損傷修復(fù)[6-7]等有關(guān),TRIM28也可以調(diào)控P53信號(hào)通路[8-9]。TRIM28與腫瘤的發(fā)生發(fā)展具有重要的調(diào)控作用

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