釀酒酵母基因組位置效應(yīng)對外源基因表達(dá)的影響
發(fā)布時間:2017-12-02 11:22
本文關(guān)鍵詞:釀酒酵母基因組位置效應(yīng)對外源基因表達(dá)的影響
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【摘要】:外源基因元件和模塊在底盤細(xì)胞中發(fā)揮特定功能是合成生物學(xué)研究的基本過程,而外源元件和模塊在基因組中的位置對其功能的實現(xiàn)具有顯著影響。為了系統(tǒng)、全面地表征釀酒酵母基因組位置效應(yīng)對外源基因的表達(dá)影響,以綠色熒光蛋白為報告基因,通過雙交換同源重組方法,對釀酒酵母單基因敲除庫進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)化,構(gòu)建釀酒酵母基因組單位點熒光標(biāo)記菌株庫。結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)和高通量測序技術(shù)對單位點熒光標(biāo)記庫菌株進(jìn)行分析,構(gòu)建高表達(dá)位點庫和低表達(dá)位點庫,共發(fā)現(xiàn)促進(jìn)綠色熒光蛋白表達(dá)的位點428個,抑制綠色熒光蛋白表達(dá)的位點444個。通過分析高、低表達(dá)位點在酵母染色體上的分布,從全基因組尺度上對釀酒酵母基因組整合位置對基因表達(dá)的影響進(jìn)行表征。本研究可為釀酒酵母基因組位置效應(yīng)的分布規(guī)律和產(chǎn)生機(jī)理研究提供重要參考,對外源蛋白工業(yè)生產(chǎn)和合成生物學(xué)中的基因表達(dá)精細(xì)調(diào)控也具有重要的指導(dǎo)意義。
【作者單位】: 天津大學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)教育部重點實驗室;天津大學(xué)化工學(xué)院天津化學(xué)化工協(xié)同創(chuàng)新中心;天津大學(xué)計算機(jī)與科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家國際科技合作項目(No.2015DFA00960) 國家自然科學(xué)基金(No.21390203) 天津市科技計劃項目(No.13RCGFSY19800)資助~~
【分類號】:Q78;Q93
【正文快照】:
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1 S.D.Ehrlich;湯懋z,
本文編號:1244749
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