本文關鍵詞：云南地方稻waxy基因序列多樣性分析

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【摘要】：利用特異引物Wx-F/AG-2對來源于云南省16個州市64個縣的252份地方稻種waxy基因中含有微衛(wèi)星序列(CT)n和第一內含子的序列進行PCR擴增并測序。結果表明在268個堿基的序列內檢測到4個變異位點:第一內含子上游56位處(CT)n存在(CT)10、(CT)11、(CT)12、(CT)14、(CT)16、(CT)17、(CT)18、(CT)19、(CT)20、(CT)21等10種變異;(CT)11、(CT)18、(CT)17、(CT)12、(CT)10等5種單倍型是云南優(yōu)勢類型,合計占供試材料的92.85%;秈稻以(CT)10、(CT)11、(CT)12為主,而粳稻以(CT)11、(CT)12、(CT)17和(CT)18為主;第一內含子+1位存在G/T變異,81.75%品種是G,T只出現在(CT)16、(CT)17、(CT)18和(CT)20的品種中,其頻率在秈稻中為13.48%,粳稻20.86%,水稻16.17%,陸稻22.35%,粘稻10.47%,糯稻42.62%。+86-88位存在ATA/GTA/A--3種變異;+128位處存在(AATT)5和(AATT)6 2種變異。根據這4個變異位點,可將252個云南地方稻種歸為16種單倍型,其中Wx4(32.54%)、Wx9(13.89%)、Wx12(12.7%)、Wx5(12.3%)、Wx1(8.33%)、Wx11(7.94%)是主要類型,合計87.7%,其他類型頻率較低。秈/粳亞種、水/陸稻和粘/糯中存在單倍型種類和單倍型頻率兩方面的差異,秈稻/粳稻、水/陸稻和粘/糯稻各亞種或生態(tài)型均有獨享的單倍型,共享單倍型頻率也存在差異,表明亞種間或生態(tài)型間發(fā)生了一定的遺傳分化。單倍型地理分布分析表明,臨滄、普洱單倍型種類最豐富,以之為中心向外擴展,單倍型種類有減少的趨勢,第一內含子+1位的T主要分布在臨滄、普洱、西雙版納、德宏等南部地區(qū)。本研究揭示了云南地方稻種群體waxy基因的變異和分布特點。
【作者單位】： 云南省農業(yè)科學院生物技術與種質資源研究所/云南省農業(yè)生物技術重點實驗室/農業(yè)部西南作物基因資源與種質創(chuàng)制重點實驗室;
【基金】：科技部基礎性工作專項(2012FY110200) 國家自然科學基金(31360331)
【分類號】：S511.22
【正文快照】： URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4996.S.20160128.1548.040.html稻米的直鏈淀粉含量主要受Wx位點控制,直鏈淀粉是影響稻米品質的重要性狀,為此該基因不僅受到自然選擇,同時受到人類長期的強烈的人工選擇。H.F.J.Bligh等[1]發(fā)現Wx基因第一內含子剪切點上游56 bp處有一

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本文編號：1227051