本文關(guān)鍵詞：has-miR-16靶基因預(yù)測及生物信息學分析

  更多相關(guān)文章： 基因 計算生物學 預(yù)測

【摘要】：目的預(yù)測has-miR-16靶基因并對靶基因的分子功能、生物學過程和信號轉(zhuǎn)導通路富集性分析,全面認識miR-16涉及的生命過程和疾病。方法通過閱讀文獻結(jié)合生物信息學預(yù)測的方法得出靶基因集合,用Cytoscape 3.2.1軟件和DAVID(the database for annnotation visualization and integrated discovery)數(shù)據(jù)庫分別對靶基因GO(gene ontology)注釋和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信號轉(zhuǎn)導通路進行富集性分析。結(jié)果各物種已知的成熟miR-16序列具有高度保守性。397個靶基因在分子功能上顯著富集于蛋白結(jié)合、DNA結(jié)合、酶類活性、胰島素樣生長因子受體活性等功能,在生物學過程顯著富集于發(fā)育過程、細胞粘附、神經(jīng)發(fā)生、細胞代謝和細胞周期調(diào)控等過程。靶基因顯著富集的信號通路有癌癥通路、p53信號通路、神經(jīng)營養(yǎng)因子信號通路等通路。結(jié)論從分析結(jié)果得出has-miR-16通過調(diào)控靶基因參與了人類生命活動和疾病過程的很多方面,尤其在癌癥的病理過程是一個值得進一步研究的方向。
【作者單位】： 南華大學公共衛(wèi)生學院預(yù)防醫(yī)學系;南華大學藥學與生物科學學院生物學系;
【基金】：國家自然科學基金(81273026) 湖南省衛(wèi)生廳科研基金(B2011-044)
【分類號】：R3416
【正文快照】： MicroRNA是一類在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達的內(nèi)生的、長度為20~24個核苷酸的非編碼小RNA[1]。其作用途徑為通過整合到RNA沉默復合物中,然后在哺乳動物體內(nèi)基于與mRNA的3'非翻譯區(qū)不完全匹配來調(diào)節(jié)靶基因表達[2]。miRNA通過調(diào)控靶基因表達的方式參與人類大部分的生物學過程和疾，

本文編號：1209619