本文關(guān)鍵詞：番茄轉(zhuǎn)錄因子基因SlYAB2a的克隆、表達及亞細胞定位分析

  更多相關(guān)文章： 番茄 SlYABa 基因克隆 表達分析 亞細胞定位

【摘要】：為了研究番茄SlYAB2a基因的功能及其在番茄生長發(fā)育中的分子機理,以番茄的cDNA為模板,利用RTPCR技術(shù)從番茄中克隆到SlYAB2a基因,該基因編碼的蛋白質(zhì)由192個氨基酸殘基組成,蛋白質(zhì)的分子量為21.35k Da,等電點是8.79,平均親水系數(shù)是-0.487。SlYAB2a蛋白質(zhì)的6~165位氨基酸殘基形成Pfam:YABBY結(jié)構(gòu)域,在20~47位有1個C2C2鋅指結(jié)構(gòu)域,在122~181位有1個螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域。二級結(jié)構(gòu)分析表明SlYAB2a蛋白分子中,α-螺旋占19.79%、β-折疊占14.06%、其余66.15%為不規(guī)則卷曲。蛋白多序列比對表明SlYAB2a與馬鈴薯、林煙草、釀酒葡萄、大豆、擬南芥、甘藍型油菜、花藥野生稻、玉米和小麥YABBY2的一致性分別為98%,78%,71%,65%,64%,64%,58%,57%,57%,說明SlYAB2a蛋白與來源于雙子葉植物的YABBY2一致性較高,而與來源于單子葉植物的一致性較低。通過聚類分析發(fā)現(xiàn)YABBY2蛋白明顯分為單子葉和雙子葉2個亞類,SlYAB2a蛋白屬于雙子葉亞類,與馬鈴薯、潘那利番茄、絨毛狀煙草、林煙草等的YABBY2蛋白序列親緣關(guān)系較近。實時定量RT-PCR分析結(jié)果表明,在番茄植物的不同生長發(fā)育時期,根、莖、葉、花、果實中,都有SlYAB2a基因表達;并且在花和青熟果實中,SlYAB2a基因表達水平遠遠高于其他組織。說明SlYAB2a基因在花和果實的發(fā)育過程中起著重要作用。洋蔥表皮細胞瞬時表達結(jié)果表明SlYAB2a蛋白定位于細胞核中。
【作者單位】： 重慶三峽學院生命科學與工程學院;
【基金】：重慶市教育委員會科學技術(shù)研究項目(KJ131101) 重慶市萬州區(qū)科學技術(shù)項目(201403063) 重慶三峽學院科學研究計劃項目(15PY03)
【分類號】：S641.2;Q943.2
【正文快照】： 高等植物的葉和花屬于側(cè)生器官,極性建立的過程是側(cè)生器官形態(tài)建成中的核心問題,也是植物發(fā)育生物學研究的熱點。側(cè)生器官的形成起始于植物的頂端分生組織,器官分化過程中需要建立基-頂軸、近-遠軸和中-側(cè)軸3個體軸極性[1]。在側(cè)生器官發(fā)育中,近-遠軸分化非常關(guān)鍵,因此,這一過

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 李鳳敏;李前忠;周歡敏;;小鼠蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測[J];內(nèi)蒙古大學學報(自然科學版);2010年02期

2 李鳳敏,李前忠;蛋白質(zhì)亞細胞定位的識別[J];生物物理學報;2004年04期

3 張松;黃波;夏學峰;孫之榮;;蛋白質(zhì)亞細胞定位的生物信息學研究[J];生物化學與生物物理進展;2007年06期

4 趙禹;趙巨東;姚龍;;用離散增量結(jié)合支持向量機方法預(yù)測蛋白質(zhì)亞細胞定位[J];生物信息學;2010年03期

5 賈蕓;呂軍;趙巨東;楊小希;;蛋白質(zhì)體積對其亞細胞定位的影響[J];氨基酸和生物資源;2013年03期

6 鄭珊珊;石卓興;代琦;姚玉華;;蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測研究進展[J];科技視界;2014年12期

7 鄭珊珊;石卓興;代琦;姚玉華;;蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測研究進展[J];科技視界;2014年15期

8 白雪源;馬玉香;羅成華;師鎖柱;侯剴;馮哲;傅博;陳香美;;人膽酸轉(zhuǎn)運蛋白基因的克隆、亞細胞定位及其在腎組織中的表達[J];中國病理生理雜志;2008年02期

9 潘宇曦;喇玉娟;馮國鄞;賀林;;運用小波分析對蛋白質(zhì)進行亞細胞定位預(yù)測(英文)[J];寧夏大學學報(自然科學版);2008年03期

10 張樹波;賴劍煌;;蛋白質(zhì)亞細胞定位預(yù)測的機器學習方法[J];計算機科學;2009年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 陳虎;孫之榮;;蛋白質(zhì)亞細胞定位:數(shù)據(jù)整合和預(yù)測系統(tǒng)[A];第十次中國生物物理學術(shù)大會論文摘要集[C];2006年

2 黃淑云;孫興玉;梁汝萍;邱建丁;;基于小波支持向量機預(yù)測蛋白質(zhì)亞細胞定位研究[A];第十一屆全國計算（機）化學學術(shù)會議論文摘要集[C];2011年

3 王東;李兵;林超;陳玉華;許雅香;沈衛(wèi)德;;家蠶細胞色素P450基因CYP6AE21的克隆、表達分析及亞細胞定位[A];中國蠶學會第六屆青年學術(shù)研討會論文集（1）[C];2009年

4 趙燕;張耀洲;童富淡;;家蠶HMGA的表達差異和亞細胞定位[A];全國動物生理生化第十二次學術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2012年

5 張鵬;印莉萍;;水稻缺鐵誘導(dǎo)高效表達基因OsNramp1的克隆、亞細胞定位及功能研究[A];中國植物生理學會第十次會員代表大會暨全國學術(shù)年會論文摘要匯編[C];2009年

6 ;石斑魚死亡調(diào)節(jié)相關(guān)基因GRIM-19的克隆和亞細胞定位分析[A];2010年中國水產(chǎn)學會學術(shù)年會論文摘要集[C];2011年

7 鄒永新;弭軍;崔金鵬;張錫宇;李曦;郭辰虹;高貴敏;陳丙璽;龔瑤琴;;CUL4B表達及其亞細胞定位分析[A];中國遺傳學會第八次代表大會暨學術(shù)討論會論文摘要匯編（2004-2008）[C];2008年

8 楊丹;張耀洲;;家蠶pBmHPC-21基因的克隆、表達及亞細胞定位[A];華東六省一市生物化學與分子生物學會2009年學術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2009年

9 徐秋芳;樂文靜;熊如意;周益軍;;RSV CP和SP基因在本氏煙中的表達與亞細胞定位分析[A];植�？萍紕�(chuàng)新與病蟲防控專業(yè)化——中國植物保護學會2011年學術(shù)年會論文集[C];2011年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 曹雋U，

本文編號：1209555