發(fā)布時(shí)間：2017-10-24 05:26

  本文關(guān)鍵詞：沙冬青AmCIP基因結(jié)構(gòu)及其內(nèi)含子生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 沙冬青 脫水素基因AmCIP 外顯子 內(nèi)含子 生物信息學(xué)分析

【摘要】：旨在分析沙冬青Am CIP基因DNA序列結(jié)構(gòu)特性及功能。以沙冬青Am CIP基因的c DNA序列設(shè)計(jì)引物,采用PCR擴(kuò)增其DNA序列,并利用生物信息學(xué)方法分析基因的結(jié)構(gòu)。序列分析表明,沙冬青Am CIP基因DNA序列長(zhǎng)1 548 bp,包含2個(gè)外顯子和1個(gè)內(nèi)含子,Gen Bank登錄號(hào)KU744005。在該基因的ORF內(nèi)存在一個(gè)78 bp的內(nèi)含子序列,同時(shí)內(nèi)含子序列中含有參與厭氧誘導(dǎo)的類增強(qiáng)子元件(GC-motif)和光響應(yīng)元件(TCCC-motif),3'-UTR區(qū)域含有多個(gè)參與光響應(yīng)、脅迫響應(yīng)和激素響應(yīng)等相關(guān)的順式作用元件,而5'-UTR區(qū)域只含有赤霉素響應(yīng)元件(GARE-motif),這些元件可能對(duì)Am CIP基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)起調(diào)控作用。此外,該基因具有較高的A+T堿基含量(64.7%),Am CIP的內(nèi)含子不具有GT-AG規(guī)則的保守序列,即內(nèi)含子5'堿基是GT,3'堿基是TG,推測(cè)Am CIP的m RNA具有獨(dú)特的剪切機(jī)制。
【作者單位】： 北京林業(yè)大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院林木育種國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室教育部林木花卉遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 沙冬青 脫水素基因AmCIP 外顯子 內(nèi)含子 生物信息學(xué)分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31270737) 高等學(xué)校學(xué)科創(chuàng)新引智計(jì)劃資助項(xiàng)目(B13007) 長(zhǎng)江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃資助項(xiàng)目(IRT13047) 北京市自然科學(xué)基金項(xiàng)目(6112016)
【分類號(hào)】：Q943.2
【正文快照】： 胚胎發(fā)育晚期豐富蛋白(Late embryonic abund-ant,簡(jiǎn)稱LEA)與種子抵抗脫水有關(guān),它伴隨種子的成熟過(guò)程產(chǎn)生,大量積累于種子成熟后期特定階段,在種子萌發(fā)后很快消失[1]。研究發(fā)現(xiàn),LEA蛋白在種子干旱中積累,以及在干旱、低溫、高溫或鹽脅迫等逆境導(dǎo)致的缺水情況下,在植物組織或生

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 潘伯榮;余其立;嚴(yán)成;;新疆沙冬青生態(tài)環(huán)境及漸危原因的研究[J];植物生態(tài)學(xué)與地植物學(xué)學(xué)報(bào);1992年03期

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4 劉楠;高飛;周宜君;張孜宸;隋欣;馬冰;張萌;張根發(fā);;蒙古沙冬青根蛋白的提取及雙向電泳體系的建立[J];北京師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2013年04期

5 劉家瓊;丘明新;;我國(guó)荒漠特有的常綠植物——沙冬青的生態(tài)生理及解剖學(xué)特征[J];Journal of Integrative Plant Biology;1982年06期

6 張濤,蔣志榮;沙冬青引種栽培的試驗(yàn)研究[J];中國(guó)沙漠;1987年03期

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9 尹林克;王燁;;沙冬青幼苗生長(zhǎng)規(guī)律初步分析[J];干旱區(qū)研究;1990年01期

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中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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4 喬慧蕾;;干旱脅迫下沙冬青中脫水素的熒光定量檢測(cè)[A];中國(guó)作物學(xué)會(huì)50周年慶祝會(huì)暨2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2011年

5 郭永忠;李振永;張?jiān)礉?rùn);李生寶;;瀕危灌木沙冬青容器育苗及造林技術(shù)研究[A];寧夏回族自治區(qū)林學(xué)會(huì)第六屆學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年

6 劉強(qiáng);王雄;馮表明;;瀕危植物沙冬青害蟲(chóng)的種類及其為害部位[A];當(dāng)代昆蟲(chóng)學(xué)研究——中國(guó)昆蟲(chóng)學(xué)會(huì)成立60周年紀(jì)念大會(huì)暨學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2004年

7 劉美芹;盧存福;沈昕;尹偉倫;;沙冬青低溫誘導(dǎo)基因的克隆與功能分析[A];2006年中國(guó)植物逆境生理生態(tài)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2006年

8 宋炳煜;郝玉光;楊R，

本文編號(hào)：1087252