本文關(guān)鍵詞：氧化葡萄糖酸桿菌WSH-003中D-山梨醇脫氫酶關(guān)鍵基因的表達(dá)分析

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【摘要】：G.oxydans WSH-003能夠高效地將D-山梨醇氧化為L-山梨糖,是工業(yè)VC生產(chǎn)的重要菌株。全基因組測序顯示,該菌中存在3種不同的D-山梨醇脫氫酶基因簇(sldh),但這3種基因簇在菌株氧化D-山梨醇過程中的表達(dá)情況還未確定。WYLY HX,首先利用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)軟件在線比對,確定了3種酶,分別為一種FAD(flavin adenine dinucleotide)輔酶依賴的山梨醇脫氫酶(FAD-SLDH)和兩種不同的PQQ(pyrroloquinoline quinone)依賴的山梨醇脫氫酶(PQQ-SLDH)。然后,利用新一代高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),對發(fā)酵過程5個時期(4、8、12、20 h和40 h)的菌體分別進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)。結(jié)果表明,基因座位為O1G_RS0104395/O1G_RS0104400的sld AB2基因在5個時期的轉(zhuǎn)錄水平FPKM(Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped reads)值均很低,而基因座位為O1G_RS0105425/O1G_RS0105430的sld AB1和基因座位為O1G_RS0106820/O1G_RS0106825/O1G_RS0106830的sld SLC基因的FPKM值較高,且都隨著D-山梨醇的快速氧化而逐漸增大。研究結(jié)果表明,sld AB1和sld SLC基因?yàn)檠趸咸烟撬釛U菌WSH-003中主要表達(dá)的D-山梨醇脫氫酶基因。本研究成果為菌株中D-山梨醇脫氫酶的后續(xù)研發(fā)提供了方向。
【作者單位】： 江南大學(xué)工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;江南大學(xué)生物工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 轉(zhuǎn)錄組測序 維生素C L-山梨糖 sldh基因簇
【基金】：國家863計劃項(xiàng)目(2012AA022103)
【分類號】：Q78;Q936
【正文快照】： 214122)氧化葡萄糖酸桿菌(Gluconobacter oxydans)是一種嚴(yán)格需氧的革蘭氏陰性菌,屬于醋酸桿菌科,該類細(xì)菌主要棲息于高糖環(huán)境,如花卉與水果中[1]。G.oxydans的細(xì)胞膜上含有大量的脫氫酶,可以快速不完全地氧化糖、糖酸和糖醇[2]。因此,G.oxydans被廣泛用于工業(yè)生產(chǎn)食品相關(guān)的

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前9條

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