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TMV和PVX脅迫下云煙和番茄實時熒光定量內(nèi)參基因篩選

發(fā)布時間:2017-10-13 08:17

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  更多相關(guān)文章: 煙草花葉病毒 馬鈴薯X病毒 寄主 實時熒光定量PCR 內(nèi)參基因


【摘要】:合適的內(nèi)參基因是采用實時熒光定量PCR研究基因表達獲得可信數(shù)據(jù)的基礎(chǔ).為了獲得合適的內(nèi)參基因,更好地研究煙草花葉病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)和馬鈴薯X病毒(Potato virus X,PVX)與煙草和番茄2種寄主的互作,本項研究根據(jù)已報道的云煙和番茄看家基因設(shè)計引物,使用geNormPlus軟件分別對其在TMV和PVX侵染下的云煙97和番茄中表達量的穩(wěn)定性進行了評估.結(jié)果表明:2種寄主植物中供試看家基因中各有4對引物滿足qPCR的要求,分別是云煙tub,CYP,GAPDH,β-tub,番茄18S,UK,ACT,EFl-α.在2種病毒侵染后的云煙內(nèi)參基因中表達最穩(wěn)定的為CYP,番茄中內(nèi)參基因為ACT.最終確定這2個看家基因分別作為實時熒光定量PCR研究煙草和番茄在TMV和PVX脅迫下寄主體內(nèi)基因表達變化的內(nèi)參基因.該結(jié)果為進一步探討2種病毒共同侵染時,它們與煙草和番茄2種寄主互作生物學(xué)效應(yīng)研究奠定了基礎(chǔ).
【作者單位】: 西南大學(xué)植物保護學(xué)院/植物病害生物學(xué)重慶市高校級重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】煙草花葉病毒 馬鈴薯X病毒 寄主 實時熒光定量PCR 內(nèi)參基因
【基金】:國家自然科學(xué)基金(30900937) 重慶市自然科學(xué)基金(CSTC2010BB1122) 中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(XNJI2009B023;2362014xk08)
【分類號】:Q943.2;S432.41
【正文快照】: 近年來,實時熒光定量PCR技術(shù)(Quantitative real time PCR,RT-qPCR)是在定性PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù),具有快速、高靈敏度等優(yōu)點,能夠準確分析在不同時期及經(jīng)過不同處理的基因表達差異[1-3].在基因定量表達研究中,被用作內(nèi)參基因的看家基因(Housekeeping gene)的

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2 馬飛;極大節(jié)旋藻實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[D];中國海洋大學(xué);2012年



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