基于EXOⅢ酶的熒光信號(hào)放大探針的高靈敏基因檢測(cè)及凝膠電泳技術(shù)篩選細(xì)胞核酸適配體
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更多相關(guān)文章: EXOⅢ酶 信號(hào)放大探針 基因檢測(cè) 凝膠電泳 細(xì)胞 核酸適配體
【摘要】:本文第一部分就信號(hào)放大技術(shù)及其在基因檢測(cè)方面的應(yīng)用作了相關(guān)研究。首先,用活化的PAA(MW=8000)交聯(lián)Fe_3O_4磁性納米粒制得表面帶有活化羧基的Fe_3O_4磁珠。利用氨基-羧基反應(yīng)將氨基化的熒光核酸探針固定在Fe_3O_4磁珠表面,制備了熒光核酸探針-Fe_3O_4磁珠復(fù)合物。Fe_3O_4磁珠不僅能夠作為分離載體,還能夠有效淬滅熒光核酸探針上的熒光基團(tuán),降低了背景熒光信號(hào),為后續(xù)熒光信號(hào)放大奠定了基礎(chǔ)。在加入待測(cè)靶分子后,靶分子與熒光核酸探針通過(guò)堿基互補(bǔ)形成雙鏈,利用核酸外切酶EXOⅢ獨(dú)特的水解特性,使得EXOⅢ水解探針并釋放出靶分子和熒光信號(hào)。靶分子繼續(xù)和過(guò)量的熒光核酸探針雜交,使EXOⅢ繼續(xù)水解釋放靶分子和熒光信號(hào),這樣熒光信號(hào)得到顯著放大,建立了基于EXOⅢ輔助的循環(huán)信號(hào)放大的DNA檢測(cè)體系。與傳統(tǒng)的分子信標(biāo)方法相比,該方法靈敏度更高,熒光信號(hào)放大能力更為顯著。此外,將雙熒光標(biāo)記的熒光探針混合,能夠通過(guò)熒光檢測(cè)信號(hào)的不同對(duì)基因SNP進(jìn)行快速分型。近年來(lái),越來(lái)越多的核酸探針應(yīng)用于識(shí)別和捕獲檢測(cè)癌細(xì)胞,用于癌癥的早期診斷和治療。核酸適配體是一種單鏈DNA/RNA探針,類(lèi)似抗體,能夠作為分子探針廣泛應(yīng)用于分子生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。本文第二部分基于瓊脂糖凝膠電泳技術(shù),結(jié)合基于細(xì)胞的指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(Cell-SELEX),對(duì)完整的靶細(xì)胞進(jìn)行核酸適體篩選。以急性早幼粒細(xì)胞白血病細(xì)胞HL-60為靶細(xì)胞,將靶細(xì)胞固定于瓊脂糖凝膠中,通過(guò)電泳過(guò)程中ssDNA與靶細(xì)胞的親和力不同而導(dǎo)致的電泳遷移率不同,分離出強(qiáng)特異性的核酸適體。通過(guò)對(duì)電泳、PCR等條件的優(yōu)化,經(jīng)5輪篩選從原始隨機(jī)ssDNA文庫(kù)中初步篩選出了對(duì)HL-60細(xì)胞特異性結(jié)合的核酸適體。
【關(guān)鍵詞】:EXOⅢ酶 信號(hào)放大探針 基因檢測(cè) 凝膠電泳 細(xì)胞 核酸適配體
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:O657.3;R440
【目錄】:
- 中文摘要4-5
- Abstract5-9
- 序言9-24
- 1. 信號(hào)放大技術(shù)9-15
- 1.1 信號(hào)放大技術(shù)概述9
- 1.2 基于核酸外切酶輔助的靶分子循環(huán)信號(hào)放大技術(shù)9-14
- 1.3 基于核酸外切酶輔助的靶分子循環(huán)信號(hào)放大技術(shù)在基因檢測(cè)中的應(yīng)用14-15
- 2. 核酸適配體的篩選15-23
- 2.1 核酸適配體概述15-16
- 2.2 核酸適體的篩選方法16-21
- 2.3 核酸適體的應(yīng)用21-23
- 3. 本文的立題思想和研究?jī)?nèi)容23-24
- 第一部分 熒光信號(hào)放大探針在基因檢測(cè)中的應(yīng)用24-41
- 第一章 基于EXOⅢ酶的熒光信號(hào)放大探針的SNP基因分型及定量測(cè)定24-41
- 1. 引言24-25
- 2. 實(shí)驗(yàn)25-28
- 3. 結(jié)果與討論28-39
- 4. 小結(jié)39-41
- 第二部分 細(xì)胞核酸適配體篩選41-65
- 第二章 建立基于瓊脂糖凝膠電泳的HL-60細(xì)胞適體篩選方法41-50
- 1. 引言41
- 2.實(shí)驗(yàn)41-45
- 3. 結(jié)果與討論45-49
- 4.小結(jié)49-50
- 第三章 單鏈次級(jí)文庫(kù)的制備50-56
- 1. 引言50
- 2. 實(shí)驗(yàn)50-52
- 3. 結(jié)果與討論52-55
- 4. 小結(jié)55-56
- 第四章 基于瓊脂糖凝膠電泳的HL-60細(xì)胞適配體篩選56-65
- 1. 引言56
- 2. 實(shí)驗(yàn)56-59
- 3. 結(jié)果與討論59-64
- 4. 小結(jié)64-65
- 結(jié)論與展望65-66
- 參考文獻(xiàn)66-74
- 攻讀學(xué)位期間本人出版或公開(kāi)發(fā)表的論著、論文74-75
- 致謝75-76
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,本文編號(hào):693412
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