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烯;-輔酶A水合酶催化機(jī)理的理論研究

發(fā)布時(shí)間:2024-04-20 21:50
  采用DFT方法研究了烯;-輔酶A(ECH)催化的4-(N,N-二甲氨基)-肉桂酰-輔酶A(DAC-CoA)和巴豆;-輔酶A(Crotonyl-CoA)水合反應(yīng).計(jì)算表明:水合反應(yīng)以分步機(jī)理進(jìn)行,經(jīng)歷一個(gè)烯醇負(fù)離子中間體.Glu164殘基作為唯一的催化堿/酸參與水合反應(yīng),而Glu144雖然沒(méi)有直接參與反應(yīng),但是它能通過(guò)氫鍵作用誘使水分子以合適的朝向活化底物.Crotonyl-CoA底物的水加成活性高于DAC-CoA.Ala98和Gly141與底物羰基之間的氫鍵作用既有利于底物的準(zhǔn)確結(jié)合,也能有效穩(wěn)定反應(yīng)中形成的過(guò)渡態(tài)和中間體.另外,Glu144和Glu164周圍的氫鍵網(wǎng)絡(luò)對(duì)于合理維持活性位點(diǎn)排布進(jìn)而有效促進(jìn)底物活化也很重要.

【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)

【文章目錄】:
1 引言
2 計(jì)算方法與模型
    2.1 計(jì)算方法
    2.2 活性位點(diǎn)模型
3 結(jié)果與討論
    3.1 DAC-Co A水合反應(yīng)
    3.2 Crotonyl-Co A水合反應(yīng)
    3.3 活性位點(diǎn)氨基酸作用
4 結(jié)論



本文編號(hào):3959982

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