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分子對接和光譜法研究FTO蛋白與小分子結(jié)構(gòu)類似物的相互作用機制

發(fā)布時間:2021-03-10 18:00
  FTO(fat mass and obesity-associated)是第一個肥胖相關基因。自FTO基因表達的蛋白被確認為首個mRNA的m6A去甲基化酶以來,其生物學功能得到廣泛拓展。近年來,研究發(fā)現(xiàn)FTO不僅引起肥胖及肥胖相關疾病,也影響肝炎、多種癌癥以及急性脊髓白血病的發(fā)展。因此,將FTO作為特定疾病的藥物靶點,開發(fā)靶向FTO選擇性抑制劑,已成為研究的熱點。研究FTO蛋白與小分子的相互作用機制,能夠指導基于結(jié)構(gòu)的靶向FTO藥物設計。本論文運用熒光分析法、圓二色譜法等多種光譜學方法,以及分子對接技術,研究了五種不同結(jié)構(gòu)的小分子與FTO蛋白的相互作用,主要包括以下部分:第一章簡要綜述了FTO蛋白的結(jié)構(gòu)與生物學功能、本論文的研究方法、內(nèi)容及意義。第二章研究了四種黃酮類化合物(白楊素、黃芩素、大豆苷元和高良姜素)與FTO的作用機理。結(jié)果顯示,四種化合物對FTO的熒光猝滅以靜態(tài)猝滅為主。結(jié)合強度的順序為白楊素>黃芩素>大豆苷元>高良姜素。第三章對八種2H-氮雜丙烯啶衍生物(1b~1h)與FTO的相互作用進行研究。八種2H-氮雜丙烯啶衍生物均引起FTO... 

【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:123 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

分子對接和光譜法研究FTO蛋白與小分子結(jié)構(gòu)類似物的相互作用機制


FTO蛋白的結(jié)構(gòu)圖

色譜,黃酮類化合物,熒光,體系


第二章四種黃酮類化合物與FTO蛋白的相互作用研究23大于峰1,且有明顯的紅移,說明FTO多肽骨架發(fā)生松動。四種黃酮類化合物均與FTO的相互作用,并導致FTO的構(gòu)象發(fā)生一定的變化。圖2.7FTO和黃酮類化合物-FTO體系的三維熒光圖,pH=7.4,T=301K。Cflavonoids=4.0×10-7M。2.3.6.3近紫外圓二色譜圓二色譜最能靈敏、方便地檢測溶液中蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化。圖2.8給出四種黃酮類化合物與FTO作用前后的CD光譜。FTO蛋白在208nm和220nm附近

黃酮類化合物,最優(yōu)模型


第二章四種黃酮類化合物與FTO蛋白的相互作用研究26FTO+高良姜素AB圖2.9FTO與黃酮類化合物對接的最優(yōu)模型。圖A中,F(xiàn)TO是用固體絲帶顯示;圖B中,結(jié)合位置的氨基酸殘基以線狀表示,綠色棍狀分子代表黃酮類化合物。綠色虛線標記氫鍵。表2.5四種黃酮類化合物在結(jié)合處的氨基酸殘基Compound氨基酸殘基白楊素PHE79,ARG80,ASP81,LEU82,ARG96,ILE97,LEU113,PHE384,GLN385,GLY386,ASN387,TYR389,CYS392,GLN468黃芩素CYS77,PHE79,ARG80,ASP81,LEU82,ILE97,LEU113,PHE114,VAL116,GLN385,GLY386,ASN387,TYR389,CYS392,GLN468大豆苷元PHE79,ARG80,ASP81,ILE97,LEU98,PHE114,THR115,VAL116,GLN385,GLY386,ASN387,TYR389,CYS392,GLN468高良姜素PHE79,ARG80,ASP81,LEU82,ARG96,ILE97,LEU113,GLN385,GLY386,ASN387,TYR389,CYS392,GLN4682.4本章小結(jié)本章用多種光譜學方法和計算機對接技術,探究了白楊素、黃芩素、大豆苷元和高良姜素與FTO的相互作用,結(jié)論如下:(1)四種黃酮類化合物均可與FTO結(jié)合,同時發(fā)生非輻射能量轉(zhuǎn)移。熒光實驗和紫外光譜證明黃酮類化合物與FTO之間存在靜態(tài)猝滅。(2)白楊素和FTO作用能力最強,其次依次為黃芩素、大豆苷元、高良姜素。羥基的位置對黃酮類化合物與FTO相互作用的影響較大,間位羥基對結(jié)合有利。(3)構(gòu)象研究表明,添加黃酮類化合物后的FTO多肽骨架發(fā)生變化,四種

【參考文獻】:
期刊論文
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[3]大豆素的營養(yǎng)生理功能研究進展[J]. 趙向輝,龔劍明,楊竹青,劉嬋娟,瞿明仁.  中國飼料. 2015(04)
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[5]分子間非共價相互作用的質(zhì)譜分析方法研究進展[J]. 張瑞萍,再帕爾·阿不力孜.  分析測試學報. 2005(01)

博士論文
[1]若干功能小分子與蛋白質(zhì)的分子識別及作用機理研究[D]. 翟春熙.吉林大學 2006

碩士論文
[1]FTO mRNA在前列腺癌和腎癌中的表達[D]. 馬宏召.蘇州大學 2018
[2]量熱法與光譜法研究FTO蛋白與小分子類似物的相互作用[D]. 任婷.鄭州大學 2017



本文編號:3075047

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