沼澤紅假單胞菌對(duì)鎘的累積及蛋白組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2025-05-11 01:05
過(guò)量的鎘攝入對(duì)人體和動(dòng)植物會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重的危害,因此鎘污染是近年來(lái)環(huán)境污染處理的一個(gè)熱門(mén)問(wèn)題。微生物對(duì)重金屬離子具有較高的耐受能力和較強(qiáng)的累積能力,且具有成本低廉、環(huán)境友好等優(yōu)點(diǎn)。所以微生物累積鎘是較好的研究方向。實(shí)驗(yàn)利用沼澤紅假單胞菌累積水體中鎘元素,研究菌體累積鎘的優(yōu)化累積條件和菌株累積飽和后的釋放;然后用TMT標(biāo)記定量技術(shù)對(duì)未接觸鎘、初代累積鎘及多代累積鎘后的菌體進(jìn)行蛋白組學(xué)分析,最后挑選表達(dá)差異量較大的蛋白進(jìn)行熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)。在對(duì)菌體累積鎘條件的研究中,實(shí)驗(yàn)研究pH在3.5-8.5范圍內(nèi)菌株的生長(zhǎng)情況及對(duì)鎘的累積效率。結(jié)果表明沼澤紅假單胞菌在pH=6.0-7.0范圍內(nèi)累積效率保持在88.9%-91.5%之間,菌株具有良好的生長(zhǎng)情況和較強(qiáng)的鎘累積能力,且菌株生長(zhǎng)和鎘累積呈正相關(guān)性。隨后考察了Cd2+的初始濃度在40-200 mg/L范圍內(nèi)對(duì)菌株生長(zhǎng)的影響,發(fā)現(xiàn),在Cd2+初始濃度為80 mg/L和120 mg/L時(shí)累積效率分別為90.3%與80.2%,Cd2+初始濃度為120 mg/L時(shí)菌株的生長(zhǎng)和對(duì)鎘的累積均受到明顯抑制。共存離子實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明K+,Ca2+,Zn2+,Co2+與C...
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
1.1 鎘的危害
1.2 鎘的主要處理方法
1.2.1 植物富集鎘
1.2.2 微生物累積鎘
1.3 微生物耐鎘機(jī)制
1.3.1 胞外沉淀
1.3.2 細(xì)胞表面累積
1.3.3 胞內(nèi)作用
1.4 蛋白組學(xué)及其在微生物累積鎘機(jī)制中的應(yīng)用
1.4.1 蛋白組學(xué)技術(shù)
1.4.2 蛋白組學(xué)在微生物鎘累積中的應(yīng)用
1.5 研究目的與意義
第2章 沼澤紅假單胞菌累積鎘及動(dòng)力學(xué)研究
2.1 材料
2.1.1 主要試劑
2.1.2 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 菌株及生長(zhǎng)環(huán)境
2.2.2 pH對(duì)沼澤紅假單胞菌的生長(zhǎng)和累積鎘的影響
2.2.3 Cd2+初始濃度對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.2.4 共存離子對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.2.5 沼澤紅假單胞菌累積鎘動(dòng)力學(xué)
2.2.6 XRD分析
2.2.7 累積后釋放
2.3 結(jié)果分析
2.3.1 pH對(duì)沼澤紅假單胞菌的生長(zhǎng)和累積鎘的影響
2.3.2 Cd2+初始濃度對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.3.3 共存離子對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.3.4 沼澤紅假單胞菌累積鎘動(dòng)力學(xué)
2.3.5 XRD分析
2.3.6 累積后釋放
2.4 討論
第3章 蛋白組學(xué)分析
3.1 材料
3.1.1 主要材料與試劑
3.1.2 主要設(shè)備
3.1.3 主要分析軟件
3.2 方法
3.2.1 預(yù)處理
3.2.2 蛋白提取、胰酶酶解及TMT標(biāo)記
3.2.3 高效液相色譜分級(jí)
3.2.4 液相色譜-質(zhì)譜連用
3.2.5 數(shù)據(jù)庫(kù)搜索
3.2.6 蛋白注釋方法
3.2.7 蛋白功能富集及聚類(lèi)分析
3.2.8 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
3.3 結(jié)果分析
3.3.1 蛋白鑒定
3.3.2 表達(dá)差異蛋白統(tǒng)計(jì)及樣品重復(fù)性檢測(cè)
3.3.3 表答差異蛋白的亞細(xì)胞定位
3.3.4 GO注釋分類(lèi)分析差異表達(dá)蛋白
3.3.5 COG蛋白功能分類(lèi)
3.3.6 KEGG通路分析表達(dá)差異蛋白
3.3.7 PPIs分析表達(dá)差異蛋白
3.4 討論
3.4.1 蛋白鑒定結(jié)果討論
3.4.2 數(shù)據(jù)分析討論
第4章 差異蛋白基因的轉(zhuǎn)錄定量分析
4.1 材料
4.1.1 主要試劑
4.1.2 主要儀器及設(shè)備
4.2 方法
4.2.1 總RNA提取
4.2.2 RNA中DNA去除
4.2.3 逆轉(zhuǎn)錄
4.2.4 熒光定量PCR
4.3 結(jié)果
4.3.1 RNA提取
4.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果
4.3.3 ahp和sod基因表達(dá)差異的比較
4.4 討論
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得學(xué)術(shù)成果
附錄A
附錄B
本文編號(hào):4044605
【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
1.1 鎘的危害
1.2 鎘的主要處理方法
1.2.1 植物富集鎘
1.2.2 微生物累積鎘
1.3 微生物耐鎘機(jī)制
1.3.1 胞外沉淀
1.3.2 細(xì)胞表面累積
1.3.3 胞內(nèi)作用
1.4 蛋白組學(xué)及其在微生物累積鎘機(jī)制中的應(yīng)用
1.4.1 蛋白組學(xué)技術(shù)
1.4.2 蛋白組學(xué)在微生物鎘累積中的應(yīng)用
1.5 研究目的與意義
第2章 沼澤紅假單胞菌累積鎘及動(dòng)力學(xué)研究
2.1 材料
2.1.1 主要試劑
2.1.2 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 菌株及生長(zhǎng)環(huán)境
2.2.2 pH對(duì)沼澤紅假單胞菌的生長(zhǎng)和累積鎘的影響
2.2.3 Cd2+初始濃度對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.2.4 共存離子對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.2.5 沼澤紅假單胞菌累積鎘動(dòng)力學(xué)
2.2.6 XRD分析
2.2.7 累積后釋放
2.3 結(jié)果分析
2.3.1 pH對(duì)沼澤紅假單胞菌的生長(zhǎng)和累積鎘的影響
2.3.2 Cd2+初始濃度對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.3.3 共存離子對(duì)沼澤紅假單胞菌累積鎘的影響
2.3.4 沼澤紅假單胞菌累積鎘動(dòng)力學(xué)
2.3.5 XRD分析
2.3.6 累積后釋放
2.4 討論
第3章 蛋白組學(xué)分析
3.1 材料
3.1.1 主要材料與試劑
3.1.2 主要設(shè)備
3.1.3 主要分析軟件
3.2 方法
3.2.1 預(yù)處理
3.2.2 蛋白提取、胰酶酶解及TMT標(biāo)記
3.2.3 高效液相色譜分級(jí)
3.2.4 液相色譜-質(zhì)譜連用
3.2.5 數(shù)據(jù)庫(kù)搜索
3.2.6 蛋白注釋方法
3.2.7 蛋白功能富集及聚類(lèi)分析
3.2.8 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
3.3 結(jié)果分析
3.3.1 蛋白鑒定
3.3.2 表達(dá)差異蛋白統(tǒng)計(jì)及樣品重復(fù)性檢測(cè)
3.3.3 表答差異蛋白的亞細(xì)胞定位
3.3.4 GO注釋分類(lèi)分析差異表達(dá)蛋白
3.3.5 COG蛋白功能分類(lèi)
3.3.6 KEGG通路分析表達(dá)差異蛋白
3.3.7 PPIs分析表達(dá)差異蛋白
3.4 討論
3.4.1 蛋白鑒定結(jié)果討論
3.4.2 數(shù)據(jù)分析討論
第4章 差異蛋白基因的轉(zhuǎn)錄定量分析
4.1 材料
4.1.1 主要試劑
4.1.2 主要儀器及設(shè)備
4.2 方法
4.2.1 總RNA提取
4.2.2 RNA中DNA去除
4.2.3 逆轉(zhuǎn)錄
4.2.4 熒光定量PCR
4.3 結(jié)果
4.3.1 RNA提取
4.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果
4.3.3 ahp和sod基因表達(dá)差異的比較
4.4 討論
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得學(xué)術(shù)成果
附錄A
附錄B
本文編號(hào):4044605
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