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基于熒光特征的海洋浮游植物快速分類方法研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-20 01:06
【摘要】:三維熒光光譜法靈敏度高,能給出整個(gè)激發(fā)、發(fā)射波長(zhǎng)范圍內(nèi)的全部熒光指紋信息,是一種可以實(shí)現(xiàn)直接、快速進(jìn)行浮游植物種類和數(shù)量分析的方法。本論文旨在通過(guò)提取光譜特征,結(jié)合多種化學(xué)計(jì)量學(xué)方法,建立基于熒光特征的海洋浮游植物快速分類方法,該分類介于生物形態(tài)分類的門類(Division)和屬(Genus)之間。 選取25種分屬于5個(gè)門類的浮游植物赤潮種或優(yōu)勢(shì)種進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng),包括7種甲藻:塔瑪亞歷山大藻(Alexandrium tamarense)、東海原甲藻(Prorocentrum micans)、海洋原甲藻(Prococentrum marinum)、裸甲藻(Gymnodinium sp.)、簡(jiǎn)裸甲藻(Gymnodinium simplex)、微型原甲藻(Prorocentrum minimum)、錐狀斯比藻(Scrippsiella trochoidea);10種硅藻:尖刺擬菱形藻(Pseudo-nitzschia pungens (PS0201-01))、中肋骨條藻(Skeletonema costatuma)、圓篩藻(Coscinodiscus sp.)、細(xì)柱藻(Cylindrotheca closterium)、盒形藻(Odontella cf_sinensis)、旋鏈角毛藻(Chaetoceros Curvisetus)、纖細(xì)角毛藻(Chaetoceros Debilis)、雙突角毛藻(Chaetoceros Didymus)、圓海鏈藻(Thalassiosi rarotula)、布氏雙尾藻(Ditylum brightwellii);2種綠藻:小球藻(Chlorella pynenoidosa)、島國(guó)大扁藻(Platymonas helgolanidica);2種藍(lán)藻:聚球藻(Synechocoocus sp.)、魚腥藻(Cyanophyceae Anabaena sp.);4種著色鞭毛藻:棕囊藻(Phaeocystis globosa)、隱藻(Rhodomonas sp.)、鹽水隱藻(Rhodomonas salina)、海洋卡盾藻(Chattonella marina),在不同實(shí)驗(yàn)條件下,包括3個(gè)溫度水平(25℃、20℃、15℃)、5個(gè)光照水平(15000 lux、10000 lux、7000 lux、4100 lux、1180 lux),對(duì)海洋浮游植物的三維熒光光譜進(jìn)行了研究。主要研究包括: 1.研究了基于熒光特征的海洋浮游植物的“光譜類別”。首先對(duì)原三維熒光光譜去除瑞利散射,采用主成分分析法(PCA)提取特征光譜。以平均相似系數(shù)R和第一主成分貢獻(xiàn)率S1/兩個(gè)度量指標(biāo)考察特征光譜的相似性。結(jié)果顯示,兩種相似性度量指標(biāo)變化趨勢(shì)基本相同,S1/的變化趨勢(shì)相對(duì)明顯。為了對(duì)浮游植物進(jìn)行分類判別,首先依據(jù)相似性度量和系統(tǒng)聚類分析結(jié)果,對(duì)每種藻提取一到多條譜代表原特征光譜,共得到25種藻的30條代表譜。結(jié)合比值法、系統(tǒng)聚類法和基于主成分分析的特征投影顯示法,將25種藻劃分成10個(gè)“光譜類別”,該類別定義以浮游植物的熒光光譜為基礎(chǔ),介于生物學(xué)概念中“門類”和“屬”之間,以Bayesian判別法驗(yàn)證了劃分類別的有效性。 2.以標(biāo)準(zhǔn)葉綠素a (Chl a)為基準(zhǔn)考察了方法的檢出限。首先,觀察標(biāo)準(zhǔn)Chl a的三維和激發(fā)熒光光譜,本文選取發(fā)射波長(zhǎng)665 nm,激發(fā)波長(zhǎng)380、410、430 nm三處熒光強(qiáng)度的均值,作為對(duì)應(yīng)濃度Chl a的熒光強(qiáng)度值,得到Chl a標(biāo)準(zhǔn)曲線。采用IUPAC法計(jì)算方法得出檢出限為0.065μg/L;采用ISO新估算法得到定性檢出限為1.85μg/L,定量檢出限為2.77μg/L。然后,考察了本實(shí)驗(yàn)儀器條件下活體浮游植物熒光光譜法的檢出限。選取三維熒光光譜中發(fā)射波長(zhǎng)670-680 nm,激發(fā)波長(zhǎng)440 nm處熒光強(qiáng)度的均值,與上述選定的標(biāo)準(zhǔn)Chl a的熒光強(qiáng)度相對(duì)應(yīng),以標(biāo)準(zhǔn)Chl a濃度來(lái)表示浮游植物的豐度。根據(jù)IUPAC得到活體浮游植物的檢出限為0.10μg/L;根據(jù)實(shí)驗(yàn)得到每種藻的實(shí)際檢出限在2.5-20.0μg/L之間。 3.建立了活體浮游植物熒光光譜的分析識(shí)別方法。采用遍歷非負(fù)最小二乘法(NNLS)對(duì)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的660個(gè)單種樣品和105個(gè)混合樣品進(jìn)行分析,討論了物種數(shù)的確定與拆分正確率的規(guī)定,選定拆分系數(shù)的閾值為0.2。在本文所確定的“光譜類別”上,單種浮游植物樣品熒光光譜的識(shí)別正確率幾乎達(dá)100%;全部混合樣品的定性正確率為87%,剔除濃度低于實(shí)際檢出限的樣品后所剩的95個(gè)混合樣品的定性正確率可以達(dá)到95%。 綜上所述,本文基于25種藻的大量光譜數(shù)據(jù),劃分了10個(gè)“光譜類別”,運(yùn)用NNLS法對(duì)單種藻和混合藻樣品的定性定量分析驗(yàn)證了此光譜分類的有效性。
【圖文】:

熒光光譜,浮游植物,熒光光譜,定性識(shí)別


a 三維熒光光譜特征 b 同步熒光光譜c 瑞利散射光譜圖1-1 浮游植物的熒光光譜特征綜上所述,對(duì)浮游植物的定性識(shí)別在門類上已取得了較為理想的結(jié)果,但進(jìn)一步細(xì)分的結(jié)果不甚理想;在方法的定量方面,尚且沒有進(jìn)行較為細(xì)致的研究。6

熒光光譜,熒光光譜,藻種,相似性


圖 3-1 25 種藻的特征熒光光譜觀察圖 3-1,藻種 Gy、Sc、Ps、Sk 和 Ch 的光譜相似性較好,而 Al、Gs、Cs、Cl、Db、Cy、Rs 的相似性較差。這一方面是由于培養(yǎng)條件的變化引起的,一方面結(jié)合生物統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)的觀察,,也可能是由于藻種的培養(yǎng)密度偏低所致。對(duì) 25 種藻的特征熒光光譜,本文使用平均相關(guān)系數(shù)R和第一主成分貢獻(xiàn)率S1/ 兩個(gè)指標(biāo)分別考察每種藻光譜的相似性!=miiS13.2 浮游植物特征熒光光譜的相似性度量相關(guān)系數(shù)ρxy是一個(gè)用來(lái)度量?jī)呻S機(jī)變量之間關(guān)系的緊密程度的指標(biāo)。其計(jì)算公式為=∑ ∑ ∑ 22( xx)(yy)/(xx)(yy)xykkkkρ ,n111
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2008
【分類號(hào)】:P734.4

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