本文關鍵詞：苯系物暴露引起的仿刺參管足轉錄組差異表達基因分析　出處：《大連海洋大學》2016年碩士論文　論文類型：學位論文

  更多相關文章： 苯系物 仿刺參 管足 差異表達基因 轉錄組測序

【摘要】：仿刺參(Apostichopus japonicus)又名刺參,主要分布于我國北方、日本、朝鮮半島及俄羅斯的遠東地區(qū),是我國沿海重要的增養(yǎng)殖品種。近年來,沿海石油化工業(yè)的發(fā)展及海洋溢油事故造成近岸海域環(huán)境石油類污染。海洋環(huán)境中苯系物污染主要來源于海洋溢油事故以及沿海石油化工企業(yè)的廢水排放。到目前為止,從分子水平上研究苯系物聯(lián)合暴露對仿刺參的影響還未見報道。本文采用Illumina HiSeqTM 2000高通量測序技術分別對1.0 mg·L-1(B)苯系物聯(lián)合暴露12h后的仿刺參管足組織及對照組(C)進行轉錄組測序,獲得了大量的差異表達基因信息。探討了仿刺參基因表達變化在BTEXs聯(lián)合暴露響應過程中發(fā)揮的作用。(1)轉錄組基礎數(shù)據(jù)分析:對BTEXs聯(lián)合暴露后仿刺參管足組織與正常對照兩個轉錄組數(shù)據(jù)合并后經(jīng)Trinity軟件進行de novo組裝,獲得了145675條unigenes,平均長度為657.21 bp。對所有unigenes進行BLAST搜索(E10-5)發(fā)現(xiàn)共有35330個unigenes(24.25%)與蛋白質數(shù)據(jù)庫中的已知序列同源,其中注釋到COG、Blast2GO、KEGG基因的個數(shù)分別為8409、10532、7305。大量基因的獲得充分顯示出轉錄組測序手段在基因序列數(shù)據(jù)挖掘上的巨大潛力。(2)轉錄組差異表達基因分析:對比分析BTEXs聯(lián)合暴露組和對照組的轉錄組基因表達結果,獲得了2418個差異表達基因(DEGs)(|Log2 Fold changes|≥1且FDR≤0.001),其中,上調表達和下調表達基因分別為1049和1369個。GOseq分析結果顯示,158個DEGs顯著富集在149個GO terms中,包括103個生物學過程、17個細胞組分和29個分子功能(p0.05);KEGG代謝通路分析結果顯示994個差異基因映射到268條代謝通路,這些差異表達基因參與的生理過程與其他生物的同源基因參與的信號傳導、癌癥、外源性化合物的生物降解代謝等過程相類似。上述結果為在轉錄組水平篩選BTEXs的生物標志物,解析BTEXs對仿刺參毒性作用的分子機制提供了科學參考。(3)差異表達基因驗證:采用real-time PCR技術對轉錄組測序結果獲得的P450 A46、GST-σ、AchE、CAT等4個差異表達基因進行了驗證,其結果和轉錄組測定結果表達趨勢一致,進一步驗證了本研究中轉錄組測序和分析的準確性。研究結果對BTEXs聯(lián)合暴露仿刺參相關特異表達基因的鑒定和功能研究提供了基礎數(shù)據(jù)。
【學位授予單位】：大連海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：X55;S917.4

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 馮志綱;于佳平;丁君;常亞青;;仿刺參基因組DNA提取方法改進[J];生物技術通報;2008年S1期

2 張文姬;侯紅漫;張公亮;李琴艷;杜晨萌;;仿刺參腸道可培養(yǎng)微生物多樣性研究[J];食品工業(yè)科技;2011年09期

3 李成華;崔靜;李曄;周君;蘇秀榕;李太武;;南移養(yǎng)殖仿刺參(Stichopus japonicus Selenka)鐵蛋白基因的克隆及表達特征分析[J];海洋與湖沼;2011年04期

4 孫璐;邱天龍;許強;劉輝;林承剛;楊紅生;;仿刺參不同體外標記方法效果的比較[J];海洋科學;2013年07期

5 張鵬;董雙林;;溫度對青色系與紅色系仿刺參生長和能量分配的影響[J];中國海洋大學學報(自然科學版);2013年08期

6 劉立明;王愛敏;王勇強;杜榮斌;楊秀蘭;;溫度和體質量對仿刺參消化道排空時間和排便量的影響[J];海洋科學;2013年09期

7 田丹;姜國良;劉云;;不同體質量仿刺參免疫活性的研究[J];海洋科學;2013年10期

8 袁文鵬;劉新;樊廷俊;張永剛;夏雪奎;劉昌衡;;仿刺參加工廢液中幾種海參皂苷化合物的分離鑒定[J];山東大學學報(理學版);2011年07期

9 趙鵬;楊紅生;孫麗娜;;仿刺參(Apostichopus japonicus)攝食和運動器官的結構與功能[J];海洋通報;2013年02期

10 ;刺參病害及無公害防治技術研究與應用[J];海洋開發(fā)與管理;2012年08期

相關會議論文 前10條

1 鐘磊;張峰;;仿刺參補體B因子基因克隆及其功能分析[A];漁業(yè)科技創(chuàng)新與發(fā)展方式轉變——2011年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2011年

2 鐘磊;張峰;畢穎;;仿刺參補體B因子溶血活性初步研究[A];漁業(yè)科技創(chuàng)新與發(fā)展方式轉變——2011年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2011年

3 李霞;王微微;李強;秦艷杰;;表皮干細胞標記物在仿刺參正常和再生體壁中的表達[A];漁業(yè)科技創(chuàng)新與發(fā)展方式轉變——2011年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2011年

4 王培勝;楊麗麗;王凱文;邰宗洋;王曉禹;宋哲;王濱;鄒向陽;;仿刺參聚巖藻糖硫酸酯對D-半乳糖致衰老小鼠的保護作用及機制研究[A];第三屆泛環(huán)渤海（七省二市）生物化學與分子生物學會——2012年學術交流會論文集[C];2012年

5 張東升;李華;劉洋;顧曉飛;豆志峰;林祥睿;宋堅;朱瑩;;仿刺參底泥中硫化物降解細菌的篩選與鑒定[A];2013年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2013年

6 彭薇;杜慧霞;鄢婧婧;呂雅萌;包振民;胡景杰;;仿刺參(Apostichopus japonicus)分子標記的開發(fā)與應用[A];2009年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2009年

7 王志富;俞志明;宋秀賢;;改性粘土治理有害藻華技術對仿刺參(Apostichopus japonicas Selenka)稚參的影響研究[A];中國海洋湖沼學會第十次全國會員代表大會暨學術研討會論文集[C];2012年

8 臧元奇;田相利;董雙林;董云偉;;仿刺參排臟及內臟再生過程中生長、代謝及免疫應答[A];漁業(yè)科技創(chuàng)新與發(fā)展方式轉變——2011年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2011年

9 白艷艷;李斌;馬元慶;張秀珍;劉愛英;劉義豪;宋向軍;孫珊;王有廷;蘇博;;生物絮團的理化分析及其對仿刺參幼參生長的影響[A];2013年中國水產(chǎn)學會學術年會論文摘要集[C];2013年

10 鄧歡;周遵春;韓家波;;胃萎縮癥仿刺參幼體及親參組織中病毒的觀察[A];中國海洋湖沼學會第九次全國會員代表大會暨學術研討會論文摘要匯編[C];2007年

相關博士學位論文 前8條

1 楊潔;仿刺參Apostichopus japonicus糖胺聚糖的制備、結構分析和活性研究[D];中國海洋大學;2015年

2 田梅琳;仿刺參（Apostichopus japonicus）高密度遺傳連鎖圖譜構建及生長性狀QTL精細定位[D];中國海洋大學;2015年

3 張鵬;鹽度、光照強度、溫度對青色系、紅色系仿刺參（Apostichopus japonicus）生長和能量分配的影響[D];中國海洋大學;2012年

4 鄢婧婧;仿刺參（Apostichopus japonicus）分子標記開發(fā)及應用[D];中國海洋大學;2013年

5 駱作勇;仿刺參幼參對不同刺激的應激機制及維生素C、E抗應激作用研究[D];中國科學院研究生院（海洋研究所）;2014年

6 彭薇;仿刺參（Apostichopus japonicus）微衛(wèi)星標記的開發(fā)與應用[D];中國海洋大學;2011年

7 劉洪展;養(yǎng)殖仿刺參對環(huán)境因子和病原的免疫應答及抗病分子機理[D];中國海洋大學;2013年

8 孫麗娜;仿刺參Apostichopus japonicus（Selenka）消化道再生的組織細胞特征與關鍵基因分析[D];中國科學院研究生院（海洋研究所）;2013年

相關碩士學位論文 前10條

1 趙薇;仿刺參中多糖活性成分研究[D];江西師范大學;2011年

2 田良;仿刺參消化道中產(chǎn)酶菌株的篩選鑒定及其在仿刺參飼料中的應用[D];集美大學;2015年

3 侯志剛;仿刺參貯藏及預煮過程的品質變化研究[D];上海海洋大學;2015年

4 王穎;仿刺參腸道組織多肽的制備及抗氧化活性研究[D];上海海洋大學;2015年

5 巴華忠;細胞外基質相關蛋白表皮生長因子和肌腱蛋白在仿刺參再生過程中的表達分析[D];遼寧師范大學;2015年

6 李樂;仿刺參生長相關基因的克隆與表達[D];遼寧師范大學;2015年

7 呂律;不同分子量仿刺參Apostichopus japonicas糖胺聚糖抗凝血、抗血栓活性研究[D];中國海洋大學;2015年

8 高美玲;仿刺參腸道細菌多樣性16S rDNA分析[D];大連工業(yè)大學;2013年

9 張文姬;仿刺參腸道菌群多樣性研究[D];大連工業(yè)大學;2011年

10 成功;仿刺參體表微生物多樣性研究[D];大連工業(yè)大學;2011年

，

本文編號：1321470