全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)是研究人類遺傳疾病的有效方法,關(guān)聯(lián)分析法能夠識別與復(fù)雜遺傳疾病有關(guān)的基因位點。由于基因位點是超高維數(shù)據(jù),傳統(tǒng)的變量選擇方法不再適用,本文使用ISIS篩選方法將超高維基因位點降至到高維,再使用SCAD變量選擇方法對降維后的高維基因位點進行進一步篩選,最終得到相關(guān)致病基因位點。此外在遺傳關(guān)聯(lián)研究中,性狀遺傳決定因素的遺傳模型并不總是可以確定的,實際上,通常不可能事先知道遺傳的真實模型。遺傳模型的錯誤指定會導(dǎo)致功耗降低。本文在全基因組關(guān)聯(lián)分析中,考慮到遺傳模型不確定的情況,在前人的研究基礎(chǔ)之上創(chuàng)新地將三種基因遺傳模型引入回歸方程,盡量減少由遺傳模型未知而造成的統(tǒng)計功效不穩(wěn)健的表現(xiàn)。在該模型下,本文提出的基于ISIS篩選方法和SCAD變量選擇方法的致病基因兩步篩選法,分析比較出這兩階段的篩選方法能夠準確地篩選出相關(guān)致病基因的位點,并且對SIS方法和ISIS方法做了篩選精度的比較。最后使用計算機模擬,模擬結(jié)果發(fā)現(xiàn)該方法對致病基因的篩選確實有一定的效果。

【文章頁數(shù)】：28 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 研究背景及意義
    1.2 基因關(guān)聯(lián)分析的國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.3 創(chuàng)新點及其主要方法
    1.4 文章的主要方法和結(jié)構(gòu)
第二章 構(gòu)造遺傳模型不確定情況下的基因模型
    2.1 基因模型不確定下的數(shù)據(jù)處理
    2.2 基因型不確定下的多基因位點模型
第三章 樣本基因模型不確定下的變量選擇
    3.1 基因模型不確定下的確定獨立篩選
    3.2 基因模型不確定下的SCAD變量選擇
        3.2.1 SCAD變量選擇方法
第四章 模擬結(jié)果與分析
    4.1 基因模型不確定下的數(shù)值模擬
        4.1.1 基于特征篩選的數(shù)值模擬
        4.1.2 基于SCAD變量選擇下的數(shù)值模擬
    4.2 模擬結(jié)果分析
第五章 總結(jié)與展望
    5.1 總結(jié)
    5.2 不足
    5.3 展望
參考文獻
致謝



本文編號：3754856