血清miRNAs作為生物標(biāo)志物應(yīng)用于非小細(xì)胞肺癌的早期診斷
本文選題:血清 + microRNA ; 參考:《南方醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:背景肺癌是全世界發(fā)病率和死亡率最高的腫瘤。據(jù)統(tǒng)計(jì),一半的肺癌患者在確診肺癌時(shí)已發(fā)生了遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,基本失去了接受根治性治療的機(jī)會,中位生存期僅有8-11個(gè)月。其中,肺癌中85%的病例為非小細(xì)胞肺癌,非小細(xì)胞肺癌又以腺癌和鱗癌兩類為主。截至目前為止,還未有一種準(zhǔn)確可靠、經(jīng)濟(jì)便捷和創(chuàng)傷性小的方法應(yīng)用于早期非小細(xì)胞肺癌患者的診斷。miRNA為一類長度約19-24個(gè)核苷酸的非編碼單鏈小分子RNA,大量的文獻(xiàn)證實(shí)其與腫瘤的發(fā)生發(fā)展以及轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)相關(guān)。自從miRNA被首次在循環(huán)系統(tǒng)中檢測到以來,其已被證實(shí)能夠穩(wěn)定地存在于血清中,而且可能作為一種無創(chuàng)性的生物標(biāo)志物應(yīng)用于腫瘤早期診斷。目的試圖找到潛在的可用于非小細(xì)胞肺癌早期診斷的血清miRNA生物標(biāo)志物。材料與方法本實(shí)驗(yàn)研究主要分為三部分進(jìn)行。在第一部分實(shí)驗(yàn)中,我們選取了 6例早期非小細(xì)胞肺癌患者和6例年齡與性別相匹配的健康人,提取其中的血清總RNA,采用丹麥Exiqon公司的miRCURYTM LNA Array篩選出早期非小細(xì)胞肺癌患者相對于健康人的差異性miRNAs表達(dá)譜,同時(shí)利用生物信息學(xué)的方法進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘獲得組織或血清樣本中非小細(xì)胞肺癌相關(guān)的差異表達(dá)miRNAs,最后將兩部分結(jié)果取交集初步篩選出差異表達(dá)的血清miRNAs;在第二部分實(shí)驗(yàn)中,我們選取了 12例早期非小細(xì)胞肺癌患者和12例年齡、性別相匹配的健康人,一共24例病例作為訓(xùn)練集進(jìn)行初步驗(yàn)證。同樣地,提取其中的血清總RNA,然后采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對第一部分中初步篩選出來的差異表達(dá)血清miRNAs進(jìn)行初步驗(yàn)證;在第三部分實(shí)驗(yàn)中,我們選取了 60例早期非小細(xì)胞肺癌患者和60例年齡、性別相匹配的健康人,一共120例病例作為驗(yàn)證集進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。同樣地,提取其中的血清總RNA,然后采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對通過前兩部分實(shí)驗(yàn)研究初步驗(yàn)證得到的差異表達(dá)血清miRNAs進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。最后,我們采用受試者工作曲線對經(jīng)過訓(xùn)練集和驗(yàn)證集雙重驗(yàn)證的差異表達(dá)血清miRNAs進(jìn)行診斷效能分析,確定潛在的可應(yīng)用于非小細(xì)胞肺癌患者早期診斷的生物標(biāo)志物。結(jié)果在第一部分實(shí)驗(yàn)中,12例病例血清提取的總RNA純度及濃度均達(dá)到后續(xù)實(shí)驗(yàn)的基本要求;每張芯片的探針點(diǎn)均成像均勻,未見有明顯異常的區(qū)域;以表達(dá)倍數(shù)變化2倍及以上,p值小于0.05的標(biāo)準(zhǔn)對芯片結(jié)果進(jìn)行篩選,可以得到122個(gè)上調(diào)差異表達(dá)的miRNAs和87個(gè)下調(diào)差異表達(dá)的miRNAs;數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果中,對于血清樣本,有31個(gè)上調(diào)差異表達(dá)的miRNAs,有28個(gè)下調(diào)差異表達(dá)的miRNAs;對于組織樣本,有172個(gè)上調(diào)差異表達(dá)的miRNA,有137個(gè)下調(diào)差異表達(dá)的miRNAs。取交集后,最終初步篩選出了 miR-185-5p、miR-431-5p、miR-484、miR-492、miR-584-5p、miR-590-3p 和 miR-631 等 7 個(gè)血清差異表達(dá)miRNAs。在第二部分實(shí)驗(yàn)中,正常對照組血清中U6的平均Ct值為23.57 ±0.23,肺癌實(shí)驗(yàn)組血清中U6的平均Ct值為23.19 ±0.25,兩組血清樣本間U6的Ct值無顯著性統(tǒng)計(jì)差異,可作為合適的內(nèi)參基因;在訓(xùn)練集中,相比于健康人,早期非小細(xì)胞肺癌患者血清中的miR-492和miR-590-3p分別上調(diào)了 1.88和1.71倍,且p值分別為0.0086和0.0141,差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)上意義;miR-631則下調(diào)了 1.46倍,且p值為0.0304,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)上意義;而miR-185-5p、miR-431-5p和miR-484等3個(gè)miRNAs雖然也呈現(xiàn)出差異性表達(dá),但是其p值均大于0.05,差異不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)上意義;miR-584-5p則顯示其Ct值大于40,提示其在血清中的含量極低,檢測不到。在第三部分實(shí)驗(yàn)中,在驗(yàn)證集中,相比于健康人,早期非小細(xì)胞肺癌患者血清中的miR-492和miR-590-3p分別上調(diào)了 1.65和1.69倍,且p值均小于0.0001,差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)上意義;miR-631則下調(diào)了 1.50倍,且p值小于0.0001,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)上意義。單獨(dú)應(yīng)用miR-492、miR-590-3p或miR-631等3個(gè)血清miRNAs對健康人和早期非小細(xì)胞肺癌患者進(jìn)行區(qū)分的AUC分別為;0.789、0.792和0.711。當(dāng)將這3個(gè)血清miRNAs作為一個(gè)組合時(shí),運(yùn)用該組合對健康人和早期非小細(xì)胞肺癌患者進(jìn)行區(qū)分的AUC達(dá)到0.828(95%CI,0.750-0.905,p = 0.000),敏感度高達(dá) 86.7%,特異度高達(dá) 71.7%。結(jié)論由miR-492、miR-590-3p和miR-631等3個(gè)血清miRNAs組成的集合可以作為一種潛在的生物標(biāo)志物應(yīng)用于非小細(xì)胞肺癌患者的早期診斷,具有一定的臨床意義。然而,此種生物標(biāo)志物的真正臨床使用,還需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)研究,尤其是大樣本、多中心參與的前瞻性臨床試驗(yàn)。
[Abstract]:In the first part of the experiment , we selected 6 patients with early non - small cell lung cancer and 6 healthy persons with age and sex . In the second experiment , the values of miR - 492 and miR - 590 - p in serum of non - small - cell lung cancer were significantly lower than those in healthy people , and the difference was statistically significant . Conclusion The combination of miR - 492 , miR - 590 - 3P and miR - 631 can be used as a potential biomarker in the early diagnosis of non - small cell lung cancer patients and has some clinical significance . However , the real clinical use of such biomarkers requires further experimental research , in particular large - sample and multi - center participation in prospective clinical trials .
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R734.2
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 孫厚良;;miRNAs的研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2006年10期
2 ;Impact of tiny miRNAs on cancers[J];World Journal of Gastroenterology;2007年04期
3 宋寶;宋現(xiàn)讓;劉杰;魏玲;;miRNAs及其靶基因的識別[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2007年09期
4 ;放療和miRNAs兩者關(guān)系的研究進(jìn)展(英文)[J];Chinese-German Journal of Clinical Oncology;2012年05期
5 王寧;黃辰;姚嘉宜;艾婷;李圍圍;付學(xué)海;宋麗萍;;肺癌相關(guān)miRNAs研究進(jìn)展[J];現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué);2012年05期
6 ;Identification of deregulated miRNAs and their targets in hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma[J];World Journal of Gastroenterology;2012年38期
7 William CS CHO;南娟;;miRNAs作為癌癥預(yù)測和預(yù)后標(biāo)志物的巨大潛能[J];中國肺癌雜志;2013年01期
8 李長貴;紀(jì)艷;;miRNAs和內(nèi)分泌疾病研究進(jìn)展[J];中華醫(yī)學(xué)信息導(dǎo)報(bào);2006年21期
9 William CS CHO;南娟;丁燕;;miRNAs在肺癌中的作用[J];中國肺癌雜志;2009年12期
10 Wen Luo,;Qinghua Nie;Xiquan Zhang;;MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J];遺傳學(xué)報(bào);2013年03期
相關(guān)會議論文 前10條
1 ;A potential role for Chlamydomonas miRNAs in response to environmental changes[A];中國遺傳學(xué)會植物遺傳和基因組學(xué)專業(yè)委員會2009年學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編[C];2009年
2 Ping Xuan;Maozu Guo;Yangchao Huang;;MaturePred:Efficient Identification of MicroRNAs within Novel Plant Pre-miRNAs[A];第五屆全國生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)術(shù)大會論文集[C];2012年
3 Zhen-Dong Xiao;Li-Ting Diao;Jian-Hua Yang;Hui Xu;Mian-Bo Huang;Yong-Jin Deng;Hui Zhou;Liang-Hu Qu;;Systematical identification of cis-elements orchestrating the expressions of miRNAs in humans[A];生命的分子機(jī)器及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)——2012年全國生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)大會摘要集[C];2012年
4 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];2011醫(yī)學(xué)科學(xué)前沿論壇第十二屆全國腫瘤藥理與化療學(xué)術(shù)會議論文集[C];2011年
5 任波;馬迪;李毅;;地高辛標(biāo)記探針結(jié)合化學(xué)發(fā)光技術(shù)快速靈敏檢測植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國植物病理學(xué)會2005年學(xué)術(shù)年會暨植物病理學(xué)報(bào)創(chuàng)刊50周年紀(jì)念會論文摘要集[C];2005年
6 任波;馬迪;李毅;;地高辛標(biāo)記探針結(jié)合化學(xué)發(fā)光技術(shù)快速靈敏檢測植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國植物病理學(xué)會2005年學(xué)術(shù)年會暨植物病理學(xué)報(bào)創(chuàng)刊50周年紀(jì)念會論文集[C];2005年
7 戚鵬;韓金祥;魯艷芹;王傳璽;欒中華;卜范峰;;病毒編碼的miRNAs:基因表達(dá)新的調(diào)控因子[A];山東省藥學(xué)會2006年生化與生物技術(shù)藥物學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2006年
8 ;Bioinformatic identification and expression analysis of new microRNAs from Medicago truncatula[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會2008年學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2008年
9 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];中華醫(yī)學(xué)會腫瘤學(xué)分會第七屆全國中青年腫瘤學(xué)術(shù)會議——中華醫(yī)學(xué)會腫瘤學(xué)分會“中華腫瘤 明日之星”大型評選活動暨中青年委員全國遴選論文匯編[C];2011年
10 ;miRNAs involved in Tau expression of BMSCs induced neurons[A];中國神經(jīng)科學(xué)學(xué)會第九屆全國學(xué)術(shù)會議暨第五次會員代表大會論文摘要集[C];2011年
相關(guān)重要報(bào)紙文章 前1條
1 江尚;特異性miRNAs與前列腺癌發(fā)病密切相關(guān)[N];中國醫(yī)藥報(bào);2007年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條
1 陳健德;新生兒膿毒癥miRNAs表達(dá)譜及其免疫調(diào)節(jié)作用研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年
2 A.B.M.Khaldun;[D];中國科學(xué)院研究生院(武漢植物園);2015年
3 成鷹;大腸桿菌和布魯氏菌脂多糖刺激條件下巨噬細(xì)胞差異表達(dá)miRNAs的鑒定及其作用機(jī)制[D];海南大學(xué);2014年
4 王奕;MiRNAs在白癜風(fēng)外周血單個(gè)核細(xì)胞中的表達(dá)及miR-3940-5p對T細(xì)胞作用機(jī)制的研究[D];山東大學(xué);2015年
5 陳科;小鼠子宮內(nèi)膜mRNAs和miRNAs時(shí)空表達(dá)與胚胎著床的關(guān)系及SPOP對基質(zhì)細(xì)胞蛻膜化的影響[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年
6 侯冬霞;游離脂肪酸在脂肪組織胰島素抵抗中的作用研究及Solexa技術(shù)在miRNAs檢測中的應(yīng)用研究[D];南京大學(xué);2011年
7 李菁;分泌的miRNAs在2型糖尿病和血管再生中的生物學(xué)功能研究[D];南京大學(xué);2011年
8 王鳳;miRNAs對TBX5的靶向調(diào)控及其遺傳變異的調(diào)控差異在先天性心臟病中的作用[D];復(fù)旦大學(xué);2012年
9 周朝偉;豬不同年齡段肌肉組織microRNAs鑒定和差異表達(dá)分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年
10 陳鍵;模擬微重力下的血清miRNAs研究[D];浙江大學(xué);2016年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 姜青華;丹參miRNAs組織特異表達(dá)譜及其靶基因鑒定[D];杭州師范大學(xué);2015年
2 劉元會;抑郁患者腦脊液和血清中差異性miRNAs鑒定的臨床研究[D];四川醫(yī)科大學(xué);2015年
3 賈文慧;宮頸癌及子宮內(nèi)膜癌血清miRNAs的研究[D];南京大學(xué);2013年
4 許成辰;不同HER-2水平的人乳腺癌MCF-7細(xì)胞內(nèi)miRNAs表達(dá)譜及相關(guān)miRNAs對癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年
5 曹文婷;奶山羊乳腺組織miRNAs的鑒定、篩選及功能的初步研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
6 劉帥帥;循環(huán)miRNAs檢測對肝癌診斷價(jià)值的meta分析[D];蚌埠醫(yī)學(xué)院;2015年
7 王蕊;喉癌相關(guān)miRNAs的篩選及其功能的初步研究[D];南華大學(xué);2015年
8 雷彬;大白豬和二花臉豬排卵前卵泡差異表達(dá)miRNAs及其靶基因鑒定[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
9 葛瑩;綿羊不同發(fā)情狀態(tài)下松果體若干miRNAs表達(dá)差異及其與AANAT靶關(guān)系鑒定[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年
10 黨春艷;高山離子芥低溫脅迫調(diào)控的miRNAs及其靶基因的表達(dá)分析[D];蘭州大學(xué);2013年
,本文編號:1732035
本文鏈接:http://www.sikaile.net/jingjilunwen/jiliangjingjilunwen/1732035.html