在過去的20年里,對基因表達譜數據的分析一直以來是統(tǒng)計學、計算機科學、生物信息學相互交叉的重要研究方向之一。對基因表達譜數據集進行分析可以揭示基因組信息與表型之間的聯系,隨著高通量技術的進一步發(fā)展,測量樣品中全部mRNA表達水平的成本越來越低,使得基因表達譜技術的應用也越來越廣泛,由此,微陣列實驗得到了大量的數據集,對基因表達譜數據選擇合適的統(tǒng)計方法已經成為一個相當重要的課題。帕金森病是一種由黑質中多巴胺能神經元死亡引起的神經退行性疾病,而胃癌是一種常見的癌癥,是由細胞異常生長引起的,也就是說,帕金森病具有細胞死亡的特點,胃癌具有細胞增殖的特點,因此帕金森病和胃癌是兩種截然不同的疾病。一項流行病學研究表明,帕金森病患者患胃癌的風險相對較低。本文旨在從兩個不同分析角度對基因表達譜數據集進行分析,以探討胃癌和帕金森病之間的關系。本文基于兩個不同的分析角度,首先,對胃癌和帕金森病基因表達譜進行基因差異表達分析（使用limma包提供的穩(wěn)健t檢驗）,其次對胃癌和帕金森病基因表達譜進行加權基因共表達網絡分析（WGCNA）。前者是單基因分析方法,對數據集中的每個基因逐個進行檢驗,后者是一種系統(tǒng)生物學... 

【文章來源】：吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】：71 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

WGCNA分析一般流程

檢驗m個假設的可能結果

ORA分析[52]

【參考文獻】：
期刊論文
[1]基因功能富集分析的研究進展[J]. 王瀟,尹天舒,李柏逸,江熹霖,孫慧,竇亞光,倪琦,田衛(wèi)東.  中國科學:生命科學. 2016(04)
[2]Mitogen-activated protein kinase signaling pathway and invasion and metastasis of gastric cancer[J]. Mei Yang,Chang-Zhi Huang.  World Journal of Gastroenterology. 2015(41)



本文編號：3313446