【摘要】：在單細(xì)胞RNA測序技術(shù)還未興起之前,大家熟知并利用的是bulk RNA測序技術(shù),即計算基因在所有細(xì)胞中表達(dá)的平均值。但這樣的數(shù)據(jù)缺失了基因在不同細(xì)胞上表達(dá)的異質(zhì)性。后來隨著科技的發(fā)展,單細(xì)胞RNA測序技術(shù)被提出。單細(xì)胞RNA測序技術(shù)能夠在單細(xì)胞水平上對整個轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,在許多生物學(xué)和醫(yī)學(xué)應(yīng)用中具有巨大的前景。盡管單細(xì)胞RNA測序技術(shù)給未來單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析提供了很好的技術(shù)支持,但因為技術(shù)問題,單細(xì)胞數(shù)據(jù)中一些低表達(dá)值或中表達(dá)值可能會無法完全觀測到,導(dǎo)致其表達(dá)值為0或有某種程度的減少,我們稱其為dropout效應(yīng)。再加上單細(xì)胞數(shù)據(jù)的稀疏特性,測序數(shù)據(jù)中的高比例0值影響了后續(xù)分析,所以對單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行填充就成了在進(jìn)行后續(xù)分析之前的一個重要步驟。本文提出雙線性回歸的填充技術(shù),首先構(gòu)造具有先驗信息的相似矩陣,為接下來的雙回歸系數(shù)篩選子集,然后通過迭代進(jìn)行行和列的加入稀疏懲罰的線性回歸進(jìn)行估計,將達(dá)到收斂條件的估計值作為最終填充值。后續(xù)數(shù)據(jù)分析表明,scBiLR能夠準(zhǔn)確恢復(fù)dropout影響下的缺失值,有助于改進(jìn)后續(xù)分析,比如差異表達(dá)分析和聚類分析。
【圖文】：

Ａ邐Ｘ逡逑圖３．１雙線性回歸圖示逡逑若僅僅只對單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞層面的回歸或基因?qū)用娴幕貧w，即逡逑每一個細(xì)胞都作為被解釋變量由其他細(xì)胞進(jìn)行回歸運算或每一個基因都作逡逑為被解釋變量由其他基因進(jìn)行回歸運算，，目標(biāo)函數(shù)應(yīng)該如下：逡逑－＝＝

差異基因同前150個標(biāo)準(zhǔn)差異基因的交集個數(shù)T叩250
【學(xué)位授予單位】：華中師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：C81

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李法君;;降解組測序技術(shù)及其研究進(jìn)展[J];生物學(xué)教學(xué);2017年04期

2 彭桂蘭;陳嘉慧;榮丹箐;;第四代測序技術(shù)[J];農(nóng)村經(jīng)濟(jì)與科技;2017年10期

3 王海;;高通量測序技術(shù)新名詞的理解和辨析[J];中國科技術(shù)語;2017年04期

4 權(quán)冰娥;李樹;;新一代DNA測序技術(shù)在法醫(yī)實踐中的應(yīng)用及其研究進(jìn)展[J];遼寧警察學(xué)院學(xué)報;2017年06期

5 鄭秋燕;李清;毛華明;冷靜;;測序技術(shù)的發(fā)展對瘤胃元基因組研究的影響[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2015年21期

6 韓齊;李媛媛;孫方達(dá);孔保華;陳倩;;新一代測序技術(shù)在食品微生物學(xué)中的應(yīng)用[J];食品工業(yè);2016年01期

7 杜兵兵;;第二代高通量測序技術(shù)的原理及其在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用進(jìn)展[J];中國繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育;2016年03期

8 周瑩;許冰瑩;;二代測序技術(shù)在臨床醫(yī)學(xué)上的相關(guān)應(yīng)用[J];昆明醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;2016年03期

9 烏日拉嘎;徐海燕;馮淑貞;孫志宏;孟和畢力格;張和平;;測序技術(shù)的研究進(jìn)展及三代測序的應(yīng)用[J];中國乳品工業(yè);2016年04期

10 郭海燕;程國虎;李擁軍;張昊;秦康樂;;高通量測序技術(shù)及其在生物學(xué)中的應(yīng)用[J];當(dāng)代畜牧;2016年12期

相關(guān)會議論文 前10條

1 趙潔;趙志軍;賈偉;師志云;趙穎;張玉英;趙s

本文編號：2708435